RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555690.5

PPP4R4-204, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, human

TSL 3

Gene PPP4R4, Length 680 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4R4-204	ENST00000555690	FANCB	Q8NB91	859 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	28.08	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	SEPT8	Q92599	483 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	HLA-C	Q95604	372 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	GPRASP2	Q96D09	838 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	ITGB5	P18084	799 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	ADAM17	P78536	824 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	28.07	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	KCNA2	P16389	499 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	MICU3	Q86XE3	530 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	CDHR1	Q96JP9	859 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	SKAP1	Q86WV1	359 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	NRCAM	Q92823	1304 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	UPP2	O95045	317 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	MTMR1	Q13613	665 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	FAM26D	Q5JW98	314 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	TOP1MT	Q969P6	601 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	MARK3	P27448	753 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	KAT6A	Q92794	2004 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PPP4R4-204	ENST00000555690	CHRNA1	P02708	482 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	PPFIA1	Q13136	1202 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	RNF20	Q5VTR2	975 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	NEK1	Q96PY6	1258 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	YME1L1	Q96TA2	773 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	JADE2	Q9NQC1	790 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	SI	P14410	1827 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		28	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		28	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	APOA5	Q6Q788	366 aa		28	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	APBB2	Q92870	758 aa		28	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	GLG1	Q92896	1179 aa		28	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		28	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		28	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	MAFG	O15525	162 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	GRIK4	Q16099	956 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	GHR	P10912	638 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	COL9A1	P20849	921 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	EPC2	Q52LR7	807 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	RPAIN	Q86UA6	219 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	NAPA	P54920	295 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	PGBD1	Q96JS3	809 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	RTN1	Q16799	776 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	RSPH3	Q86UC2	560 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	RASEF	Q8IZ41	740 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	SAMD11	Q96NU1	681 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	PCYT2	Q99447	389 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
PPP4R4-204	ENST00000555690	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZBTB43	O43298	467 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	IGBP1	P78318	339 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	MGAT3	Q09327	533 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	FUT2	Q10981	343 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	LPIN1	Q14693	890 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	TMEM192	Q8IY95	271 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PPP4R4-204	ENST00000555690	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06

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