RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554365.1

SPTLC2-202, Transcript of serine palmitoyltransferase long chain base subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene SPTLC2, Length 604 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC2-202ENST00000554365 VSIG10LQ86VR7 867 aa16.09■□□□□ 0.17
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SPTLC2-202ENST00000554365 DBF4BQ8NFT6 615 aa16.09■□□□□ 0.17
SPTLC2-202ENST00000554365 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
SPTLC2-202ENST00000554365 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
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SPTLC2-202ENST00000554365 C16orf70Q9BSU1 422 aa16.08■□□□□ 0.16
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SPTLC2-202ENST00000554365 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa16.06■□□□□ 0.16
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SPTLC2-202ENST00000554365 CYFIP1Q7L576 1253 aa16.04■□□□□ 0.16
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SPTLC2-202ENST00000554365 PI4K2BG5E9Z4 385 aa16.03■□□□□ 0.16
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SPTLC2-202ENST00000554365 GPR37L1O60883 481 aa16.03■□□□□ 0.16
SPTLC2-202ENST00000554365 CALM1P0DP23 149 aa16.03■□□□□ 0.16
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SPTLC2-202ENST00000554365 CALM3P0DP25 149 aa16.03■□□□□ 0.16
SPTLC2-202ENST00000554365 GNAT1P11488 350 aa16.03■□□□□ 0.16
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SPTLC2-202ENST00000554365 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
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SPTLC2-202ENST00000554365 FUT2Q10981 343 aa16.03■□□□□ 0.16
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