RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 CYP3A4P08684 503 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 FOSBP53539 338 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 SEPT1Q8WYJ6 367 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 SLC9A2Q9UBY0 812 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 MAFGO15525 162 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 BFSP2Q13515 415 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 PRR16Q569H4 304 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 OTOP2Q7RTS6 562 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 BLIDQ8IZY5 108 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 PCYT2Q99447 389 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 SDF4Q9BRK5 362 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 RNPEPQ9H4A4 650 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 SETD4Q9NVD3 440 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
PTPRU-211ENST00000531385 NFASCO94856 1347 aa21.32■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 C17orf102A2RUQ5 167 aa21.32■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 M0R2N6 131 aa21.32■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 PITPNM1O00562 1244 aa21.32■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 TREHO43280 583 aa21.32■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 CCNE2O96020 404 aa21.32■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 IQCF3P0C7M6 154 aa21.32■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 ACTR2P61160 394 aa21.32■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 NIPA1Q7RTP0 329 aa21.32■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 RETREG2Q8NC44 543 aa21.32■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 TBCKQ8TEA7 893 aa21.32■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 GRXCR1A8MXD5 290 aa21.31■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 CKBP12277 381 aa21.31■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 HOXC8P31273 242 aa21.31■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 PTK7Q13308 1070 aa21.31■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 MCTP2Q6DN12 878 aa21.31■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 DAGLBQ8NCG7 672 aa21.31■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 LMBR1Q8WVP7 490 aa21.31■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 GLG1Q92896 1179 aa21.31■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 ATP6V0A1Q93050 837 aa21.31■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 LENG9Q96B70 501 aa21.31■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 PHF20Q9BVI0 1012 aa21.31■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 KAT6AQ92794 2004 aa21.31■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 CDH23Q9H251 3354 aa21.31■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 FGBP02675 491 aa21.3■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 LRRC8DQ7L1W4 858 aa21.3■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC155Q8N6L0 562 aa21.3■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 CAGE1Q8TC20 777 aa21.3■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 OXER1Q8TDS5 423 aa21.3■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 GJA10Q969M2 543 aa21.3■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 ZBTB10Q96DT7 871 aa21.3■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF577Q9BSK1 485 aa21.3■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 DHX15O43143 795 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 TDP2O95551 362 aa21.29■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 SELPP16109 830 aa21.29■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 CIITAP33076 1130 aa21.29■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 SETQ01105 290 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 GPNMBQ14956 572 aa21.29■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF618Q5T7W0 954 aa21.29■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 RASIP1Q5U651 963 aa21.29■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 TRAF7Q6Q0C0 670 aa21.29■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 SERINC5Q86VE9 423 aa21.29■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.29■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 AFAP1L1Q8TED9 768 aa21.29■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 HERVK_113Q902F9 699 aa21.29■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 FAM161BQ96MY7 647 aa21.29■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 EMSYQ7Z589 1322 aa21.29■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 ZBBXA8MT70 800 aa21.28■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 LGR5O75473 907 aa21.28■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 CTSHP09668 335 aa21.28■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 THPOP40225 353 aa21.28■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 RBM25P49756 843 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 RBL2Q08999 1139 aa21.28■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 PPFIA1Q13136 1202 aa21.28■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 INF2Q27J81 1249 aa21.28■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 DEFB123Q8N688 67 aa21.28■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.28■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa21.28■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 ERAP1Q9NZ08 941 aa21.28■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.28■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 GBF1Q92538 1859 aa21.28■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 FAM205CA6NFA0 338 aa21.27■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 IGBP1P78318 339 aa21.27■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 MBTPS1Q14703 1052 aa21.27■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 TCTN1Q2MV58 587 aa21.27■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 RUFY4Q6ZNE9 571 aa21.27■■□□□ 1
PTPRU-211ENST00000531385 MSH4O15457 936 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRU-211ENST00000531385 NBNO60934 754 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRU-211ENST00000531385 PBX2P40425 430 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRU-211ENST00000531385 ADAM17P78536 824 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRU-211ENST00000531385 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
PTPRU-211ENST00000531385 PLCB4Q15147 1175 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRU-211ENST00000531385 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP21.26■□□□□ 0.99
PTPRU-211ENST00000531385 GRIK4Q16099 956 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRU-211ENST00000531385 GALNT17Q6IS24 598 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRU-211ENST00000531385 ABHD15Q6UXT9 468 aa21.26■□□□□ 0.99
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