RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521962.1

HACE1-211, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 4

Gene HACE1, Length 561 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-211ENST00000521962 CHD9Q3L8U1 2897 aa18.75■□□□□ 0.59
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HACE1-211ENST00000521962 KIF28PB7ZC32 967 aa18.74■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 NOP56O00567 594 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 MSH4O15457 936 aa18.74■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 SLC37A4O43826 429 aa18.74■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 PPFIA4O75335 1185 aa18.74■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 CCNE2O96020 404 aa18.74■□□□□ 0.59
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HACE1-211ENST00000521962 Q4G0T1 1027 aa18.74■□□□□ 0.59
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HACE1-211ENST00000521962 NEK8Q86SG6 692 aa18.74■□□□□ 0.59
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HACE1-211ENST00000521962 GJA10Q969M2 543 aa18.74■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 TOX2Q96NM4 488 aa18.74■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 BRMS1Q9HCU9 246 aa18.74■□□□□ 0.59
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HACE1-211ENST00000521962 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
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HACE1-211ENST00000521962 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
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HACE1-211ENST00000521962 MFSD10Q14728 455 aa18.72■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 LETM2Q2VYF4 491 aa18.72■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 NFRKBQ6P4R8 1299 aa18.72■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 ETNPPLQ8TBG4 499 aa18.72■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 SNX21Q969T3 373 aa18.72■□□□□ 0.59
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HACE1-211ENST00000521962 SDF4Q9BRK5 362 aa18.72■□□□□ 0.59
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HACE1-211ENST00000521962 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
HACE1-211ENST00000521962 MROH7Q68CQ1 1323 aa18.72■□□□□ 0.59
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HACE1-211ENST00000521962 KIAA0753Q2KHM9 967 aa18.71■□□□□ 0.59
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HACE1-211ENST00000521962 SLC5A5Q92911 643 aa18.71■□□□□ 0.59
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HACE1-211ENST00000521962 CHMP4BP1P59074 171 aa18.7■□□□□ 0.58
HACE1-211ENST00000521962 KATNAL1Q9BW62 490 aa18.7■□□□□ 0.58
HACE1-211ENST00000521962 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa18.7■□□□□ 0.58
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HACE1-211ENST00000521962 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
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HACE1-211ENST00000521962 HDAC6Q9UBN7 1215 aa18.7■□□□□ 0.58
HACE1-211ENST00000521962 SMC3Q9UQE7 1217 aa18.7■□□□□ 0.58
HACE1-211ENST00000521962 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
HACE1-211ENST00000521962 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
HACE1-211ENST00000521962 PSMD10O75832 226 aa18.69■□□□□ 0.58
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HACE1-211ENST00000521962 HOXC8P31273 242 aa18.69■□□□□ 0.58
HACE1-211ENST00000521962 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
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HACE1-211ENST00000521962 POTEDQ86YR6 584 aa18.69■□□□□ 0.58
HACE1-211ENST00000521962 TBC1D22BQ9NU19 505 aa18.69■□□□□ 0.58
HACE1-211ENST00000521962 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa18.69■□□□□ 0.58
HACE1-211ENST00000521962 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa18.68■□□□□ 0.58
HACE1-211ENST00000521962 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP18.68■□□□□ 0.58
HACE1-211ENST00000521962 ABHD15Q6UXT9 468 aa18.68■□□□□ 0.58
HACE1-211ENST00000521962 NOSTRINQ8IVI9 506 aa18.68■□□□□ 0.58
HACE1-211ENST00000521962 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
HACE1-211ENST00000521962 HAS1Q92839 578 aa18.68■□□□□ 0.58
HACE1-211ENST00000521962 RIT2Q99578 217 aa18.68■□□□□ 0.58
HACE1-211ENST00000521962 TMEM39AQ9NV64 488 aa18.68■□□□□ 0.58
HACE1-211ENST00000521962 KIF3AQ9Y496 699 aa18.68■□□□□ 0.58
HACE1-211ENST00000521962 UMODL1Q5DID0 1318 aa18.68■□□□□ 0.58
HACE1-211ENST00000521962 TLR3O15455 904 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
HACE1-211ENST00000521962 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa18.67■□□□□ 0.58
HACE1-211ENST00000521962 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa18.67■□□□□ 0.58
HACE1-211ENST00000521962 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa18.67■□□□□ 0.58
HACE1-211ENST00000521962 CYP2C9P11712 490 aa18.67■□□□□ 0.58
HACE1-211ENST00000521962 MARK3P27448 753 aa18.67■□□□□ 0.58
HACE1-211ENST00000521962 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
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