RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517488.1

PDGFRB-202, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene PDGFRB, Length 822 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-202ENST00000517488 MCTP2Q6DN12 878 aa16.06■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 PLA2G4DQ86XP0 818 aa16.06■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 NECAB1Q8N987 351 aa16.06■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 BICD2Q8TD16 824 aa16.06■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 UIMC1Q96RL1 719 aa16.06■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 RNPEPQ9H4A4 650 aa16.06■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 SETD4Q9NVD3 440 aa16.06■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 NFASCO94856 1347 aa16.05■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa16.05■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 CDKL5O76039 1030 aa16.05■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 CKBP12277 381 aa16.05■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 SELPP16109 830 aa16.05■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 RBL2Q08999 1139 aa16.05■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 NPY5RQ15761 445 aa16.05■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 ME3Q16798 604 aa16.05■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 TRAF7Q6Q0C0 670 aa16.05■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 NIPA1Q7RTP0 329 aa16.05■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 SERINC5Q86VE9 423 aa16.05■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 CCDC155Q8N6L0 562 aa16.05■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 AFAP1L1Q8TED9 768 aa16.05■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 ATP6V0A1Q93050 837 aa16.05■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 PCYT2Q99447 389 aa16.05■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 SDF4Q9BRK5 362 aa16.05■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 MTMR10Q9NXD2 777 aa16.05■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 SLC9A2Q9UBY0 812 aa16.05■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 PCDHA4Q9UN74 947 aa16.05■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 MYH7BA7E2Y1 1941 aa16.04■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 TREHO43280 583 aa16.04■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 MARK3P27448 753 aa16.04■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 RFC2P35250 354 aa16.04■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 ACTR2P61160 394 aa16.04■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 LRRC8DQ7L1W4 858 aa16.04■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 GLG1Q92896 1179 aa16.04■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 FAM161BQ96MY7 647 aa16.04■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 M0R2N6 131 aa16.03■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 DHX15O43143 795 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 LGR5O75473 907 aa16.03■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 CCNE2O96020 404 aa16.03■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 PFKMP08237 780 aa16.03■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 CIITAP33076 1130 aa16.03■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 PRR16Q569H4 304 aa16.03■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 ZNF618Q5T7W0 954 aa16.03■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 BLIDQ8IZY5 108 aa16.03■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 LMBR1Q8WVP7 490 aa16.03■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 GTF3C6Q969F1 213 aa16.03■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 LENG9Q96B70 501 aa16.03■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa16.03■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 GJB4Q9NTQ9 266 aa16.03■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 ERAP1Q9NZ08 941 aa16.03■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 KCNJ14Q9UNX9 436 aa16.03■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 STK36Q9NRP7 1315 aa16.02■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 ZBBXA8MT70 800 aa16.02■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 NBNO60934 754 aa16.02■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 THPOP40225 353 aa16.02■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 PBX2P40425 430 aa16.02■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 ADAM17P78536 824 aa16.02■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 MBTPS1Q14703 1052 aa16.02■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 ZNF697Q5TEC3 545 aa16.02■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 DAGLBQ8NCG7 672 aa16.02■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 ZNF577Q9BSK1 485 aa16.02■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 SEMA6BQ9H3T3 888 aa16.02■□□□□ 0.16
PDGFRB-202ENST00000517488 EMSYQ7Z589 1322 aa16.01■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 ATG7O95352 703 aa16.01■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 GNAT1P11488 350 aa16.01■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 FDPSP14324 419 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 DNAJB2P25686 324 aa16.01■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 SETQ01105 290 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 PPFIA1Q13136 1202 aa16.01■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 TCTN1Q2MV58 587 aa16.01■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 GALNT17Q6IS24 598 aa16.01■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 TBCKQ8TEA7 893 aa16.01■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 GUCD1Q96NT3 240 aa16.01■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 KIF2CQ99661 725 aa16.01■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 PBX4Q9BYU1 374 aa16.01■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa16.01■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 NRCAMQ92823 1304 aa16■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 DOCK5Q9H7D0 1870 aa16■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 JAK2O60674 1132 aa16■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 CXCL10P02778 98 aa16■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 ACTN1P12814 892 aa16■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 STAT5BP51692 787 aa16■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 USP11P51784 963 aa16■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 ST3GAL1Q11201 340 aa16■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 GRIK4Q16099 956 aa16■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 ABHD15Q6UXT9 468 aa16■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 RUFY4Q6ZNE9 571 aa16■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 TIFAQ96CG3 184 aa16■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 ZBTB10Q96DT7 871 aa16■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 PHF20Q9BVI0 1012 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms