RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515707.1

ABCC3-217, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ABCC3, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC3-217ENST00000515707 FAM86B1E9PN63 330 aa23■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 FGBP02675 491 aa23■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 FAM86B2P0C5J1 330 aa23■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 IQCF3P0C7M6 154 aa23■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 ARP10275 920 aa23■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 NLRP5P59047 1200 aa23■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 Q7L0L9 218 aa23■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 LRRC8DQ7L1W4 858 aa23■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 SERINC5Q86VE9 423 aa23■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 TET1Q8NFU7 2136 aa23■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.99■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 SELPP16109 830 aa22.99■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 NEK4P51957 841 aa22.99■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.99■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.99■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.99■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 AIFM3Q96NN9 605 aa22.99■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.99■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 CKBP12277 381 aa22.98■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.98■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.98■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 WNT8BQ93098 351 aa22.98■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.98■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 LARGE1O95461 756 aa22.97■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 GNAT1P11488 350 aa22.97■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 ACTR2P61160 394 aa22.97■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.97■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 GALNT17Q6IS24 598 aa22.97■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.97■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 GLG1Q92896 1179 aa22.97■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 GTF3C6Q969F1 213 aa22.97■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.97■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.97■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 CDH23Q9H251 3354 aa22.97■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 LGR5O75473 907 aa22.96■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 CTDNEP1O95476 244 aa22.96■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 CIITAP33076 1130 aa22.96■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 NPY5RQ15761 445 aa22.96■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 ME3Q16798 604 aa22.96■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 BLIDQ8IZY5 108 aa22.96■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 MTMR10Q9NXD2 777 aa22.96■■□□□ 1.27
ABCC3-217ENST00000515707 TREHO43280 583 aa22.95■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 ACTN1P12814 892 aa22.95■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 DNAJB2P25686 324 aa22.95■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 MARK3P27448 753 aa22.95■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 PRR16Q569H4 304 aa22.95■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 NRCAMQ92823 1304 aa22.95■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.95■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 AZI2Q9H6S1 392 aa22.95■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 SETD4Q9NVD3 440 aa22.95■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.95■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 WDR81Q562E7 1941 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 SIP14410 1827 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 TMEM265A0A087WTH1 108 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 ZBBXA8MT70 800 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 M0R2N6 131 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 CCNE2O96020 404 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 ADAM17P78536 824 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 PPFIA1Q13136 1202 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 NECAB1Q8N987 351 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 LENG9Q96B70 501 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 PCYT2Q99447 389 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 PTPRSQ13332 1948 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 CAND2O75155 1236 aa22.93■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 XBP1P17861 261 aa22.93■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 THPOP40225 353 aa22.93■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 USP11P51784 963 aa22.93■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 TBCKQ8TEA7 893 aa22.93■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 WASF1Q92558 559 aa22.93■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa22.93■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 COL6A3P12111 3177 aa22.93■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 GRXCR1A8MXD5 290 aa22.92■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 NBNO60934 754 aa22.92■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 ATG7O95352 703 aa22.92■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 CXCL10P02778 98 aa22.92■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 GPNMBQ14956 572 aa22.92■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.92■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.92■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa22.91■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 EDIL3O43854 480 aa22.91■■□□□ 1.26
ABCC3-217ENST00000515707 DTNBO60941 627 aa22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms