RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 PLIN4Q96Q06 1357 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 MYO7AQ13402 2215 aa7.4□□□□□ -1.22
RRN3P1-201ENST00000514813 HTTP42858 3142 aa7.4□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 NAV1Q8NEY1 1877 aa7.4□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 UPP2O95045 317 aa7.4□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 CYBAP13498 195 aa7.4□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 IFNAR1P17181 557 aa7.4□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 MAPK1P28482 360 aa7.4□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 KIAA0753Q2KHM9 967 aa7.4□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC35G1Q2M3R5 365 aa7.4□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.4□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 TMX3Q96JJ7 454 aa7.4□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 BARHL2Q9NY43 387 aa7.4□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 DOCK2Q92608 1830 aa7.4□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa7.4□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 FOSP01100 380 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 HOXC6P09630 235 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 KRT2P35908 639 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 NT5C2P49902 561 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 ITGA7Q13683 1181 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 DGKDQ16760 1214 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 HSDL1Q3SXM5 330 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 NCAPH2Q6IBW4 605 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 PDXDC2PQ6P474 469 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 OTOP2Q7RTS6 562 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 DNERQ8NFT8 737 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 PLIN2Q99541 437 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 ARAP2Q8WZ64 1704 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 ATP2A1O14983 1001 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 ARIH2O95376 493 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 BAG4O95429 457 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 CD46P15529 392 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 GJB2P29033 226 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 CYP2C18P33260 490 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 CA8P35219 290 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 NEDD9Q14511 834 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 KRT40Q6A162 431 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 ECM29Q5VYK3 1845 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 PLA2G6O60733 806 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 SWSAP1Q6NVH7 229 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM92Q6UXU6 159 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 MS4A3Q96HJ5 214 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 SCLYQ96I15 445 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 MTUS1Q9ULD2 1270 aa7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 DNAH12Q6ZR08 3092 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 STXBP3O00186 592 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 ARP10275 920 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 NBPF20Q3BBV1 942 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 TSGA10IPQ3SY00 556 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 DUSP28Q4G0W2 176 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 CEP55Q53EZ4 464 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 LRCH2Q5VUJ6 765 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 MICALL1Q8N3F8 863 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 ATP6V0A1Q93050 837 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 PANK2Q9BZ23 570 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 GLT8D2Q9H1C3 349 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 KCNH7Q9NS40 1196 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 SETD4Q9NVD3 440 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 KLHL42Q9P2K6 505 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A1W2PQY0 241 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 PFKFB2O60825 505 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 ATP9AO75110 1047 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 TDP2O95551 362 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 THPOP40225 353 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 LAMC2Q13753 1193 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 BECN1Q14457 450 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 LRRC26Q2I0M4 334 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 VSIG10LQ86VR7 867 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 TPH2Q8IWU9 490 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 GTF3C6Q969F1 213 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 CDHR1Q96JP9 859 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 IWS1Q96ST2 819 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A0C4DFX4 3053 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 FIBPO43427 364 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 MIER3Q7Z3K6 550 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-201ENST00000514813 MTA3Q9BTC8 594 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms