RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506464.5

ABCC3-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, human

TSL 4

Gene ABCC3, Length 540 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC3-208	ENST00000506464	CEP55	Q53EZ4	464 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	RUFY3	Q7L099	469 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	RPAIN	Q86UA6	219 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	RSPH3	Q86UC2	560 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	BRF1	Q92994	677 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	IL17RA	Q96F46	866 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	SDF4	Q9BRK5	362 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	ANO3	Q9BYT9	981 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	TET1	Q8NFU7	2136 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	KAT6A	Q92794	2004 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	TREH	O43280	583 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	TLL1	O43897	1013 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	ATP9A	O75110	1047 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	CA3	P07451	260 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	CDC27	P30260	824 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	EVC	P57679	992 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	ANAPC15	P60006	121 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	ADAM17	P78536	824 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	APOBR	Q0VD83	1088 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	GPNMB	Q14956	572 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	BICD2	Q8TD16	824 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	SEPT8	Q92599	483 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	APBB2	Q92870	758 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	AZI2	Q9H6S1	392 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	C6orf50	Q9HD87	102 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ABCC3-208	ENST00000506464	CDH23	Q9H251	3354 aa		13.96	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	GJB5	O95377	273 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	AMH	P03971	560 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC26A2	P50443	739 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	ARHGAP4	P98171	946 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	SP4	Q02446	784 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	HIC1	Q14526	733 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM26D	Q5JW98	314 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	GLG1	Q92896	1179 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	WNT8B	Q93098	351 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	RAD9A	Q99638	391 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	SETD4	Q9NVD3	440 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	MEIS1	O00470	390 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	CYP3A4	P08684	503 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	MYOG	P15173	224 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	IFNAR1	P17181	557 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	IGFBP4	P22692	258 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF76	P36508	570 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	PPFIA1	Q13136	1202 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	TRIM50	Q86XT4	487 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	PTPRS	Q13332	1948 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	TAP1	Q03518	808 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	MBTPS1	Q14703	1052 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	INSL6	Q9Y581	213 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	COL4A6	Q14031	1691 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	ATG7	O95352	703 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ABCC3-208	ENST00000506464	ACTR2	P61160	394 aa		13.92	□□□□□ -0.18

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms