RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498428.5

ROBO1-211, Transcript of roundabout guidance receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ROBO1, Length 3,566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO1-211ENST00000498428 HPS5Q9UPZ3 1129 aa7.95□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP7.95□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa7.95□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 POTEB2H3BUK9 544 aa7.95□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 CSPG5O95196 566 aa7.95□□□□□ -1.14
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ROBO1-211ENST00000498428 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa7.95□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 ADGRF4Q8IZF3 695 aa7.95□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 OPTNQ96CV9 577 aa7.95□□□□□ -1.14
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ROBO1-211ENST00000498428 USP17L13C9JLJ4 530 aa7.95□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 USP17L11C9JVI0 530 aa7.95□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 USP17L18D6R9N7 530 aa7.95□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 USP17L22D6RA61 530 aa7.95□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 USP17L17D6RBQ6 530 aa7.95□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 USP17L19D6RCP7 530 aa7.95□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 USP17L20D6RJB6 530 aa7.95□□□□□ -1.14
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ROBO1-211ENST00000498428 USP17L24Q0WX57 530 aa7.95□□□□□ -1.14
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ROBO1-211ENST00000498428 SCYL3Q8IZE3 742 aa7.95□□□□□ -1.14
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ROBO1-211ENST00000498428 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
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ROBO1-211ENST00000498428 CYB5D1Q6P9G0 228 aa7.94□□□□□ -1.14
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ROBO1-211ENST00000498428 BICD1Q96G01 975 aa7.94□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
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ROBO1-211ENST00000498428 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa7.94□□□□□ -1.14
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ROBO1-211ENST00000498428 CCDC148Q8NFR7 591 aa7.94□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 IFNAR1P17181 557 aa7.94□□□□□ -1.14
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ROBO1-211ENST00000498428 FILIP1LQ4L180 1135 aa7.94□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 HOOK3Q86VS8 718 aa7.94□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 TMEM139Q8IV31 216 aa7.94□□□□□ -1.14
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ROBO1-211ENST00000498428 ATG4CQ96DT6 458 aa7.94□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 SDF4Q9BRK5 362 aa7.94□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 GBP3Q9H0R5 595 aa7.94□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 ZHX3Q9H4I2 956 aa7.94□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 PSTPIP2Q9H939 334 aa7.94□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 COL24A1Q17RW2 1714 aa7.93□□□□□ -1.14
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ROBO1-211ENST00000498428 AGPSO00116 658 aa7.93□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 CHMP2AO43633 222 aa7.93□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.93□□□□□ -1.143e-9■■■■□ 21.9
ROBO1-211ENST00000498428 FLT3P36888 993 aa7.93□□□□□ -1.14
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ROBO1-211ENST00000498428 CD151P48509 253 aa7.93□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 SCNN1BP51168 640 aa7.93□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF543Q08ER8 600 aa7.93□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 SLC30A9Q6PML9 568 aa7.93□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa7.93□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 ANKRD35Q8N283 1001 aa7.93□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 SLX1AQ9BQ83 275 aa7.93□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 BATF3Q9NR55 127 aa7.93□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 TMEM260Q9NX78 707 aa7.93□□□□□ -1.14
ROBO1-211ENST00000498428 COL4A5P29400 1685 aa7.93□□□□□ -1.14
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