RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.33□□□□□ -1.4
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PTPRK-215ENST00000498284 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 ANKLE2Q86XL3 938 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 KIF18BQ86Y91 864 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
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PTPRK-215ENST00000498284 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.33□□□□□ -1.4
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PTPRK-215ENST00000498284 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
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PTPRK-215ENST00000498284 C1QTNF9P0C862 333 aa6.32□□□□□ -1.4
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PTPRK-215ENST00000498284 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.32□□□□□ -1.4
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PTPRK-215ENST00000498284 TMX1Q9H3N1 280 aa6.32□□□□□ -1.4
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PTPRK-215ENST00000498284 SCDO00767 359 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 TSPAN15O95858 294 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 CYP2C8P10632 490 aa6.31□□□□□ -1.4
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PTPRK-215ENST00000498284 LCE1DQ5T752 114 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 CPZQ66K79 652 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.31□□□□□ -1.4
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PTPRK-215ENST00000498284 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa6.31□□□□□ -1.4
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PTPRK-215ENST00000498284 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
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PTPRK-215ENST00000498284 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.31□□□□□ -1.4
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PTPRK-215ENST00000498284 SSPNQ14714 243 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 SEC23AQ15436 765 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 RNF180Q86T96 592 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 TMEFF1Q8IYR6 380 aa6.3□□□□□ -1.4
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PTPRK-215ENST00000498284 SPC25Q9HBM1 224 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.3□□□□□ -1.4
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PTPRK-215ENST00000498284 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 DNAJC6O75061 913 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 HIP1RO75146 1068 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 SOX5P35711 763 aa6.29□□□□□ -1.4
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PTPRK-215ENST00000498284 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 IFT57Q9NWB7 429 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 KCTD3Q9Y597 815 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 GAS7O60861 476 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 C8AP07357 584 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 PI3P19957 117 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 DSG1Q02413 1049 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF124Q15973 351 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-215ENST00000498284 KCNA10Q16322 511 aa6.28□□□□□ -1.4
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