RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 LINC00271P0C7V0 271 aa7.16□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 STAG3L1P0CL83 205 aa7.16□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 SNHG28P0DPA3 235 aa7.16□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 CCND2P30279 289 aa7.16□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 HOXC8P31273 242 aa7.16□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 GNPTABQ3T906 1256 aa7.16□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa7.16□□□□□ -1.26
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CBX1-205ENST00000495350 KCNG4Q8TDN1 519 aa7.16□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 TBC1D5Q92609 795 aa7.16□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 PDCD2LQ9BRP1 358 aa7.16□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
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CBX1-205ENST00000495350 SETD4Q9NVD3 440 aa7.16□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.16□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 SORCS3Q9UPU3 1222 aa7.16□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa7.16□□□□□ -1.26
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CBX1-205ENST00000495350 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
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CBX1-205ENST00000495350 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa7.15□□□□□ -1.26
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CBX1-205ENST00000495350 M0QZ92 97 aa7.15□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 ENPP3O14638 875 aa7.15□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 PER2O15055 1255 aa7.15□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 PPFIA3O75145 1194 aa7.15□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 DGKIO75912 1065 aa7.15□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 PCP11498 1178 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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CBX1-205ENST00000495350 UBE3AQ05086 875 aa7.15□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 CAMK1Q14012 370 aa7.15□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 NEDD9Q14511 834 aa7.15□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 QRICH1Q2TAL8 776 aa7.15□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 ASPRV1Q53RT3 343 aa7.15□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 FAM26DQ5JW98 314 aa7.15□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 MFSD6Q6ZSS7 791 aa7.15□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa7.15□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 NPAS4Q8IUM7 802 aa7.15□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 ADGRF4Q8IZF3 695 aa7.15□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 SUSD6Q92537 303 aa7.15□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 HINFPQ9BQA5 517 aa7.15□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 FTHL17Q9BXU8 183 aa7.15□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 OSBPL7Q9BZF2 842 aa7.15□□□□□ -1.26
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CBX1-205ENST00000495350 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CBX1-205ENST00000495350 KAT14Q9H8E8 782 aa7.15□□□□□ -1.26
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CBX1-205ENST00000495350 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
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CBX1-205ENST00000495350 HAND2P61296 217 aa7.14□□□□□ -1.27
CBX1-205ENST00000495350 LPIN1Q14693 890 aa7.14□□□□□ -1.27
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CBX1-205ENST00000495350 LMBR1Q8WVP7 490 aa7.14□□□□□ -1.27
CBX1-205ENST00000495350 ESR2Q92731 530 aa7.14□□□□□ -1.27
CBX1-205ENST00000495350 DCHS1Q96JQ0 3298 aa7.14□□□□□ -1.27
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CBX1-205ENST00000495350 EPG5Q9HCE0 2579 aa7.14□□□□□ -1.27
CBX1-205ENST00000495350 VAT1LQ9HCJ6 419 aa7.14□□□□□ -1.27
CBX1-205ENST00000495350 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CBX1-205ENST00000495350 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CBX1-205ENST00000495350 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CBX1-205ENST00000495350 TUBE1Q9UJT0 475 aa7.14□□□□□ -1.27
CBX1-205ENST00000495350 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa7.14□□□□□ -1.27
CBX1-205ENST00000495350 NCOR2Q9Y618 2525 aa7.13□□□□□ -1.27
CBX1-205ENST00000495350 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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