RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492417.5

TRA2B-215, Transcript of transformer 2 beta homolog, human

TSL 1 (best)

Gene TRA2B, Length 4,141 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRA2B-215	ENST00000492417	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	KCNB2	Q92953	911 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	NACC1	Q96RE7	527 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	FNBP1	Q96RU3	617 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	LXN	Q9BS40	222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CA12	O43570	354 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	STRN	O43815	780 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SLC37A4	O43826	429 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	EXOC3	O60645	756 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PEX3	P56589	373 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	KRT76	Q01546	638 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	FSTL1	Q12841	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PTPN14	Q15678	1187 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	STX1A	Q16623	288 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	USP49	Q70CQ1	688 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	RSPH3	Q86UC2	560 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	RETREG2	Q8NC44	543 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	DEFB118	Q96PH6	123 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PXMP2	Q9NR77	195 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PANK4	Q9NVE7	773 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	USP25	Q9UHP3	1055 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	GPR25	O00155	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	KIF3C	O14782	793 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TLR2	O60603	784 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PLA2G4B	P0C869	781 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF286B	P0CG31	522 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	LIG4	P49917	911 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	USP11	P51784	963 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ARID5A	Q03989	594 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PRKCZ	Q05513	592 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	LBX2	Q6XYB7	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	GBP3	Q9H0R5	595 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	PARP2	Q9UGN5	583 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SBF2	Q86WG5	1849 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	SPEF2	Q9C093	1822 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CLIC2	O15247	247 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	UPP2	O95045	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TNNT1	P13805	278 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	LBX1	P52954	281 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CETN1	Q12798	172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	RNF180	Q86T96	592 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	KIF18A	Q8NI77	898 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TMEM143	Q96AN5	459 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	FAM20A	Q96MK3	541 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	MAP3K14	Q99558	947 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TINF2	Q9BSI4	451 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CREBZF	Q9NS37	354 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRA2B-215	ENST00000492417	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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