RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490709.1

GLIS3-216, Transcript of GLIS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GLIS3, Length 768 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3-216ENST00000490709 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
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GLIS3-216ENST00000490709 ARP10275 920 aa23.15■■□□□ 1.3
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GLIS3-216ENST00000490709 ZNF576Q9H609 170 aa23.14■■□□□ 1.29
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GLIS3-216ENST00000490709 FAM86B1E9PN63 330 aa23.1■■□□□ 1.29
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GLIS3-216ENST00000490709 IGBP1P78318 339 aa23.07■■□□□ 1.28
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GLIS3-216ENST00000490709 ZNF577Q9BSK1 485 aa23.07■■□□□ 1.28
GLIS3-216ENST00000490709 TPCN1Q9ULQ1 816 aa23.07■■□□□ 1.28
GLIS3-216ENST00000490709 CDKL5O76039 1030 aa23.06■■□□□ 1.28
GLIS3-216ENST00000490709 STAT5BP51692 787 aa23.06■■□□□ 1.28
GLIS3-216ENST00000490709 WDR5P61964 334 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
GLIS3-216ENST00000490709 TCTN1Q2MV58 587 aa23.06■■□□□ 1.28
GLIS3-216ENST00000490709 PRR16Q569H4 304 aa23.06■■□□□ 1.28
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