RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489318.1

C9orf3-220, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-220ENST00000489318 ADORA2AP29274 412 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 APLP1P51693 650 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 AMPD3Q01432 767 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 PDE4DQ08499 809 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 CUL4BQ13620 913 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 KCNB1Q14721 858 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 DPCR1Q3MIW9 517 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 POTEGQ6S5H5 508 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 PLEKHH3Q7Z736 793 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 UIMC1Q96RL1 719 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 PLIN2Q99541 437 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 LRRC27Q9C0I9 530 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 DNAJC25Q9H1X3 360 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 KIAA1024Q9UPX6 916 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 WDR64B1ANS9 1081 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 CA12O43570 354 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 CHMP2AO43633 222 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 COBLO75128 1261 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 CCNE2O96020 404 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 TGFB3P10600 412 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 CASP1P29466 404 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 IRF5Q13568 498 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 WDR78Q5VTH9 848 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 CYP4F22Q6NT55 531 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 KCNV1Q6PIU1 500 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 SV2BQ7L1I2 683 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 MIER3Q7Z3K6 550 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 STAMQ92783 540 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 ZIC5Q96T25 663 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 CFHR5Q9BXR6 569 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 BLZF1Q9H2G9 400 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 RMND1Q9NWS8 449 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 CPA4Q9UI42 421 aa12.85□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 A0A087WWV3 80 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 E9PMD0 336 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 BIN1O00499 593 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 RHOBTB3O94955 611 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 EYA4O95677 639 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 RPN1P04843 607 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 HOXC6P09630 235 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF165P49910 485 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 SLC12A3P55017 1021 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 EHHADHQ08426 723 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 CRHR2Q13324 411 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 MCM6Q14566 821 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 IQCB1Q15051 598 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 UVSSAQ2YD98 709 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 MORN1Q5T089 497 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 ARMCX2Q7L311 632 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 MLKLQ8NB16 471 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 DYDC2Q96IM9 177 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 CAPNS2Q96L46 248 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 LXNQ9BS40 222 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 KATNBL1Q9H079 304 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 RGL1Q9NZL6 768 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 PKD2L1Q9P0L9 805 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 SLC9A2Q9UBY0 812 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa12.84□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 DOCK3Q8IZD9 2030 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-220ENST00000489318 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-220ENST00000489318 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-220ENST00000489318 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-220ENST00000489318 FRMD3A2A2Y4 597 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-220ENST00000489318 MYMKA6NI61 221 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-220ENST00000489318 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-220ENST00000489318 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-220ENST00000489318 ATG7O95352 703 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-220ENST00000489318 P4HBP07237 508 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-220ENST00000489318 PLA2G4BP0C869 781 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-220ENST00000489318 CYP11B2P19099 503 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-220ENST00000489318 SP2Q02086 613 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-220ENST00000489318 CYP4A11Q02928 519 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-220ENST00000489318 NEDD9Q14511 834 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-220ENST00000489318 DEFB115Q30KQ5 88 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-220ENST00000489318 COBLL1Q53SF7 1204 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-220ENST00000489318 UNC13DQ70J99 1090 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-220ENST00000489318 C4orf19Q8IY42 314 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-220ENST00000489318 USP6NLQ92738 828 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-220ENST00000489318 DNAJC19Q96DA6 116 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-220ENST00000489318 MAML3Q96JK9 1138 aa12.83□□□□□ -0.36
C9orf3-220ENST00000489318 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms