RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484305.1

HDAC1-209, Transcript of histone deacetylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC1, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1-209ENST00000484305 HOXC8P31273 242 aa14.71□□□□□ -0.05
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HDAC1-209ENST00000484305 WDR81Q562E7 1941 aa14.67□□□□□ -0.06
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HDAC1-209ENST00000484305 TIFAQ96CG3 184 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC1-209ENST00000484305 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
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HDAC1-209ENST00000484305 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC1-209ENST00000484305 MYO9BQ13459 2157 aa14.67□□□□□ -0.06
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HDAC1-209ENST00000484305 TMEM265A0A087WTH1 108 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC1-209ENST00000484305 RSPH10B2B2RC85 870 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC1-209ENST00000484305 M0R2N6 131 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC1-209ENST00000484305 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HDAC1-209ENST00000484305 CDKL5O76039 1030 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC1-209ENST00000484305 CXCL10P02778 98 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC1-209ENST00000484305 RSPH10BP0C881 870 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC1-209ENST00000484305 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HDAC1-209ENST00000484305 CIITAP33076 1130 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC1-209ENST00000484305 RABGGTBP53611 331 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC1-209ENST00000484305 PPFIA1Q13136 1202 aa14.66□□□□□ -0.06
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