RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-208ENST00000482785 CEP89Q96ST8 783 aa4.83□□□□□ -1.64
SHQ1-208ENST00000482785 TNKS2Q9H2K2 1166 aa4.83□□□□□ -1.64
SHQ1-208ENST00000482785 EHMT1Q9H9B1 1298 aa4.83□□□□□ -1.64
SHQ1-208ENST00000482785 GPAMQ9HCL2 828 aa4.83□□□□□ -1.64
SHQ1-208ENST00000482785 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa4.83□□□□□ -1.64
SHQ1-208ENST00000482785 ZFATQ9P243 1243 aa4.83□□□□□ -1.64
SHQ1-208ENST00000482785 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
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SHQ1-208ENST00000482785 MYO10Q9HD67 2058 aa4.83□□□□□ -1.64
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SHQ1-208ENST00000482785 BRMS1Q9HCU9 246 aa4.82□□□□□ -1.64
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SHQ1-208ENST00000482785 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa4.81□□□□□ -1.64
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SHQ1-208ENST00000482785 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa4.81□□□□□ -1.64
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SHQ1-208ENST00000482785 MOGSQ13724 837 aa4.8□□□□□ -1.64
SHQ1-208ENST00000482785 COL28A1Q2UY09 1125 aa4.8□□□□□ -1.64
SHQ1-208ENST00000482785 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SHQ1-208ENST00000482785 TMEM67Q5HYA8 995 aa4.8□□□□□ -1.64
SHQ1-208ENST00000482785 SPATC1Q76KD6 591 aa4.8□□□□□ -1.64
SHQ1-208ENST00000482785 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
SHQ1-208ENST00000482785 SLC44A5Q8NCS7 719 aa4.8□□□□□ -1.64
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