RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480000.5

APOBEC3G-204, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 2

Gene APOBEC3G, Length 812 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-204ENST00000480000 SLC27A2O14975 620 aa14.6□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 MAFGO15525 162 aa14.6□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 MGAT3Q09327 533 aa14.6□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 FUT2Q10981 343 aa14.6□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 MARCH8Q5T0T0 291 aa14.6□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 TEX2Q8IWB9 1127 aa14.6□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 CRIPAKQ8N1N5 446 aa14.6□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 FANCBQ8NB91 859 aa14.6□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa14.6□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 H3BNC9 293 aa14.59□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 LEXMQ3ZCV2 418 aa14.59□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 EPC2Q52LR7 807 aa14.59□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 FAM117BQ6P1L5 589 aa14.59□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.59□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 NLRX1Q86UT6 975 aa14.59□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14.59□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 IL27Q8NEV9 243 aa14.59□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 PIBF1Q8WXW3 757 aa14.59□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 SEPT1Q8WYJ6 367 aa14.59□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 APBB2Q92870 758 aa14.59□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 SAMD11Q96NU1 681 aa14.59□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 PCYT2Q99447 389 aa14.59□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa14.59□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 EPHX3Q9H6B9 360 aa14.59□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 CD320Q9NPF0 282 aa14.59□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 TTC3P53804 2025 aa14.59□□□□□ -0.07
APOBEC3G-204ENST00000480000 CALM1P0DP23 149 aa14.58□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 CALM2P0DP24 149 aa14.58□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 CALM3P0DP25 149 aa14.58□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.58□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 CREB3L3Q68CJ9 461 aa14.58□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 TAF2Q6P1X5 1199 aa14.58□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 CASC1Q6TDU7 716 aa14.58□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 RUFY4Q6ZNE9 571 aa14.58□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 NEK9Q8TD19 979 aa14.58□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 CUL5Q93034 780 aa14.58□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 CDHR1Q96JP9 859 aa14.58□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa14.58□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 JADE2Q9NQC1 790 aa14.58□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.58□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 MTUS1Q9ULD2 1270 aa14.58□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 C5orf67F2Z3F1 127 aa14.57□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 ENPP3O14638 875 aa14.57□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 RXRAP19793 462 aa14.57□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 LPIN1Q14693 890 aa14.57□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.57□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 FBXO22Q8NEZ5 403 aa14.57□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 C11orf16Q9NQ32 467 aa14.57□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.57□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.57□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 CCDC69A6NI79 296 aa14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 PI4K2BG5E9Z4 385 aa14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 ATG7O95352 703 aa14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 CTSHP09668 335 aa14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 ARHGAP4P98171 946 aa14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 FAM178BQ8IXR5 827 aa14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 TMEM192Q8IY95 271 aa14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 ERAP1Q9NZ08 941 aa14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 SQORQ9Y6N5 450 aa14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 GPR37L1O60883 481 aa14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 MTMR1Q13613 665 aa14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 UBE2SQ16763 222 aa14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 FBXO47Q5MNV8 452 aa14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 KCNH7Q9NS40 1196 aa14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 GRXCR2A6NFK2 248 aa14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 MEIS1O00470 390 aa14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 RB1P06400 928 aa14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 CLK2P49760 499 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 PPFIA1Q13136 1202 aa14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 GPM6BQ13491 265 aa14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 GRIK4Q16099 956 aa14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 CTC1Q2NKJ3 1217 aa14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 BMP2KLQ5H9B9 411 aa14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 APOA5Q6Q788 366 aa14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3G-204ENST00000480000 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms