RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 NCOA7Q8NI08 942 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTB-209ENST00000473257 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTB-209ENST00000473257 TOP1MTQ969P6 601 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTB-209ENST00000473257 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
ACTB-209ENST00000473257 LRRC2Q9BYS8 371 aa12.93□□□□□ -0.34
ACTB-209ENST00000473257 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
ACTB-209ENST00000473257 PIEZO1Q92508 2521 aa12.93□□□□□ -0.34
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ACTB-209ENST00000473257 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
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ACTB-209ENST00000473257 ADAM17P78536 824 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTB-209ENST00000473257 NEDD9Q14511 834 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTB-209ENST00000473257 LEXMQ3ZCV2 418 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTB-209ENST00000473257 SKAP1Q86WV1 359 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTB-209ENST00000473257 FAM178BQ8IXR5 827 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTB-209ENST00000473257 USP26Q9BXU7 913 aa12.92□□□□□ -0.34
ACTB-209ENST00000473257 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa12.91□□□□□ -0.34
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ACTB-209ENST00000473257 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
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ACTB-209ENST00000473257 GRM6O15303 877 aa12.9□□□□□ -0.34
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ACTB-209ENST00000473257 LINC01599Q8WXQ3 324 aa12.9□□□□□ -0.34
ACTB-209ENST00000473257 MAP4K1Q92918 833 aa12.9□□□□□ -0.34
ACTB-209ENST00000473257 CUL5Q93034 780 aa12.9□□□□□ -0.34
ACTB-209ENST00000473257 PGBD1Q96JS3 809 aa12.9□□□□□ -0.34
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ACTB-209ENST00000473257 SPZ1Q9BXG8 430 aa12.9□□□□□ -0.34
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ACTB-209ENST00000473257 NLRX1Q86UT6 975 aa12.88□□□□□ -0.35
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ACTB-209ENST00000473257 IGFLR1Q9H665 355 aa12.88□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 EHMT1Q9H9B1 1298 aa12.88□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 TUBE1Q9UJT0 475 aa12.88□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa12.88□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa12.88□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 NRCAMQ92823 1304 aa12.88□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 CCDC69A6NI79 296 aa12.87□□□□□ -0.35
ACTB-209ENST00000473257 SLC27A2O14975 620 aa12.87□□□□□ -0.35
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