RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, human

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO18-208	ENST00000470089	IQCF3	P0C7M6	154 aa		33.33	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	CAGE1	Q8TC20	777 aa		33.33	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	WNT8B	Q93098	351 aa		33.33	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	GTF3C6	Q969F1	213 aa		33.33	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	VWCE	Q96DN2	955 aa		33.33	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	KAT6A	Q92794	2004 aa		33.33	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	33.32	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	FGB	P02675	491 aa		33.32	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	PTK7	Q13308	1070 aa		33.32	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	33.32	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	BLID	Q8IZY5	108 aa		33.32	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		33.32	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	MARK3	P27448	753 aa		33.31	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	NPY5R	Q15761	445 aa		33.31	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089		Q7L0L9	218 aa		33.31	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		33.31	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	GLG1	Q92896	1179 aa		33.31	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		33.31	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		33.31	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		33.31	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	SETD4	Q9NVD3	440 aa		33.31	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	ACTR2	P61160	394 aa		33.3	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		33.3	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	KIF2C	Q99661	725 aa		33.3	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	TREH	O43280	583 aa		33.29	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	EDIL3	O43854	480 aa		33.29	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	CKB	P12277	381 aa		33.29	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	HOXC8	P31273	242 aa		33.29	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	PRR16	Q569H4	304 aa		33.29	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	33.29	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	GPR153	Q6NV75	609 aa		33.29	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		33.29	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	HERVK_113	Q902F9	699 aa		33.29	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	PCYT2	Q99447	389 aa		33.29	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	33.29	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	TET1	Q8NFU7	2136 aa		33.29	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		33.28	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089		M0R2N6	131 aa		33.28	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	33.28	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	CIITA	P33076	1130 aa		33.28	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	33.28	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	RASIP1	Q5U651	963 aa		33.28	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		33.28	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	TBCK	Q8TEA7	893 aa		33.28	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		33.28	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		33.28	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	CCNE2	O96020	404 aa		33.27	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	SELP	P16109	830 aa		33.27	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	RFC2	P35250	354 aa		33.27	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	RBL2	Q08999	1139 aa		33.27	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	GALNT17	Q6IS24	598 aa		33.27	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	SERINC5	Q86VE9	423 aa		33.27	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	33.27	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	DEFB123	Q8N688	67 aa		33.27	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		33.27	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		33.27	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	EMSY	Q7Z589	1322 aa		33.27	■■■□□ 2.92
FBXO18-208	ENST00000470089	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	LGR5	O75473	907 aa		33.26	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	ST3GAL1	Q11201	340 aa		33.26	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		33.26	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	LENG9	Q96B70	501 aa		33.26	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	33.26	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	JAK2	O60674	1132 aa		33.25	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	PFKM	P08237	780 aa		33.25	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	XBP1	P17861	261 aa		33.25	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		33.25	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	AZI2	Q9H6S1	392 aa		33.25	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		33.24	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	GNAT1	P11488	350 aa		33.24	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	THPO	P40225	353 aa		33.24	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	USP11	P51784	963 aa		33.24	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	GPNMB	Q14956	572 aa		33.24	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	WASF1	Q92558	559 aa		33.24	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	33.24	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		33.24	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	ZBBX	A8MT70	800 aa		33.23	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	PPFIA1	Q13136	1202 aa		33.23	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	NRCAM	Q92823	1304 aa		33.23	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	ATG7	O95352	703 aa		33.22	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	FOSB	P53539	338 aa		33.22	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	ADAM17	P78536	824 aa		33.22	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	33.22	■■■□□ 2.91	8e-7	■■■□□ 14.9
FBXO18-208	ENST00000470089	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		33.22	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		33.22	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	OXER1	Q8TDS5	423 aa		33.22	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM161B	Q96MY7	647 aa		33.22	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		33.22	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	GBF1	Q92538	1859 aa		33.22	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	TDP2	O95551	362 aa		33.21	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	STAT5B	P51692	787 aa		33.21	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	GRIK4	Q16099	956 aa		33.21	■■■□□ 2.91

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