RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 MLXIPQ9HAP2 919 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 COL6A3P12111 3177 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 MICAL3Q7RTP6 2002 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 SPDYE3A6NKU9 549 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 hCG_1984214I3L0E3 225 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 MEIS1O00470 390 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 KPNA6O60684 536 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 F2P00734 622 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 LGALS2P05162 132 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 CYP3A4P08684 503 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGAP4P98171 946 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 MFSD10Q14728 455 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM132AQ24JP5 1023 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 KIAA0753Q2KHM9 967 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM47CQ5HY64 1035 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 XRRA1Q6P2D8 792 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 NFRKBQ6P4R8 1299 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNV1Q6PIU1 500 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 METTL7BQ6UX53 244 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 SESTD1Q86VW0 696 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 OXER1Q8TDS5 423 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 GJA10Q969M2 543 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 LENG9Q96B70 501 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 GPRASP2Q96D09 838 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 ZBTB10Q96DT7 871 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 SENP7Q9BQF6 1050 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 RNPEPQ9H4A4 650 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNH7Q9NS40 1196 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 EYSQ5T1H1 3165 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 MROH7Q68CQ1 1323 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM205CA6NFA0 338 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 WNT7AO00755 349 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 TLR3O15455 904 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 PPFIA4O75335 1185 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 DEXIO95424 95 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 CCNE2O96020 404 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 FOSP01100 380 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 HOXC8P31273 242 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 RBM25P49756 843 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 FOSBP53539 338 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 NLRP5P59047 1200 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAM17P78536 824 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 AP3B2Q13367 1082 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 MTMR1Q13613 665 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 NEDD9Q14511 834 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 LRIT3Q3SXY7 679 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 GNPTABQ3T906 1256 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 CEP55Q53EZ4 464 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 NLRX1Q86UT6 975 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 GTF3C6Q969F1 213 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 PHF20Q9BVI0 1012 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 C22orf23Q9BZE7 217 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 HIPK3Q9H422 1215 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 C6orf50Q9HD87 102 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 SH3GLB2Q9NR46 395 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 CDH23Q9H251 3354 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 REV3LO60673 3130 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 CHD7Q9P2D1 2997 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PPC1 479 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 GRXCR1A8MXD5 290 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 H3BRB1 525 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 CPLX1O14810 134 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 TREHO43280 583 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 ATG7O95352 703 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 IQCF3P0C7M6 154 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP4AP20648 1035 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 MARK3P27448 753 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 CIITAP33076 1130 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 FPGSQ05932 587 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 PTGISQ16647 500 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 RASIP1Q5U651 963 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF365Q70YC5 407 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 Q7L0L9 218 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 PLA2G4DQ86XP0 818 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 BLIDQ8IZY5 108 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 TBCKQ8TEA7 893 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGEF1-206ENST00000461017 SEPT1Q8WYJ6 367 aa7.99□□□□□ -1.13
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