RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 TANC1Q9C0D5 1861 aa23.57■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 C17orf102A2RUQ5 167 aa23.56■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 PITPNM1O00562 1244 aa23.56■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa23.56■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa23.56■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 USP11P51784 963 aa23.56■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.56■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.56■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 SCLYQ96I15 445 aa23.56■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 ZNF577Q9BSK1 485 aa23.56■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 IL23AQ9NPF7 189 aa23.56■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 ACRP10323 421 aa23.55■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 ACTR2P61160 394 aa23.55■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 HIC1Q14526 733 aa23.55■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 RETREG2Q8NC44 543 aa23.55■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 CAGE1Q8TC20 777 aa23.55■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 GLG1Q92896 1179 aa23.55■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 UIMC1Q96RL1 719 aa23.55■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.367e-6■□□□□ 9.4
VARS-218ENST00000459667 EMSYQ7Z589 1322 aa23.55■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 EDIL3O43854 480 aa23.54■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 HOXC8P31273 242 aa23.54■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 PTK7Q13308 1070 aa23.54■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 C16orf59Q7L2K0 433 aa23.54■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 IL27Q8NEV9 243 aa23.54■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 LENG9Q96B70 501 aa23.54■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 LRCH3Q96II8 777 aa23.54■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 RNPEPQ9H4A4 650 aa23.54■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa23.54■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 ERAP1Q9NZ08 941 aa23.54■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa23.53■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 DHX15O43143 795 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 ST18O60284 1047 aa23.53■■□□□ 1.36
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VARS-218ENST00000459667 MARK3P27448 753 aa23.53■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 TMEM240Q5SV17 173 aa23.53■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 OXER1Q8TDS5 423 aa23.53■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 AFAP1L1Q8TED9 768 aa23.53■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.53■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.53■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 PCYT2Q99447 389 aa23.53■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 AZI2Q9H6S1 392 aa23.53■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 TBC1D22BQ9NU19 505 aa23.53■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 SCN5AQ14524 2016 aa23.52■■□□□ 1.36
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VARS-218ENST00000459667 IQCF3P0C7M6 154 aa23.52■■□□□ 1.36
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VARS-218ENST00000459667 RBL2Q08999 1139 aa23.52■■□□□ 1.36
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VARS-218ENST00000459667 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa23.52■■□□□ 1.36
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VARS-218ENST00000459667 TDP2O95551 362 aa23.51■■□□□ 1.35
VARS-218ENST00000459667 GNAT1P11488 350 aa23.51■■□□□ 1.35
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VARS-218ENST00000459667 KRT2P35908 639 aa23.51■■□□□ 1.35
VARS-218ENST00000459667 SERINC5Q86VE9 423 aa23.51■■□□□ 1.35
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VARS-218ENST00000459667 WNT8BQ93098 351 aa23.51■■□□□ 1.35
VARS-218ENST00000459667 MSH4O15457 936 aa23.5■■□□□ 1.35
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VARS-218ENST00000459667 FGBP02675 491 aa23.5■■□□□ 1.35
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VARS-218ENST00000459667 SELPP16109 830 aa23.5■■□□□ 1.35
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VARS-218ENST00000459667 TRIM29Q14134 588 aa23.5■■□□□ 1.35
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VARS-218ENST00000459667 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
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VARS-218ENST00000459667 ABHD15Q6UXT9 468 aa23.49■■□□□ 1.35
VARS-218ENST00000459667 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa23.49■■□□□ 1.35
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