RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454225.1

CITED1-210, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene CITED1, Length 716 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-210ENST00000454225 SDF4Q9BRK5 362 aa29.45■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 RNPEPQ9H4A4 650 aa29.45■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 SEC24BO95487 1268 aa29.44■■■□□ 2.3
CITED1-210ENST00000454225 HOXC8P31273 242 aa29.44■■■□□ 2.3
CITED1-210ENST00000454225 SERINC5Q86VE9 423 aa29.44■■■□□ 2.3
CITED1-210ENST00000454225 GUCD1Q96NT3 240 aa29.44■■■□□ 2.3
CITED1-210ENST00000454225 SEMA6BQ9H3T3 888 aa29.44■■■□□ 2.3
CITED1-210ENST00000454225 SETD4Q9NVD3 440 aa29.44■■■□□ 2.3
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CITED1-210ENST00000454225 TPCN1Q9ULQ1 816 aa29.44■■■□□ 2.3
CITED1-210ENST00000454225 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa29.44■■■□□ 2.3
CITED1-210ENST00000454225 FAM86B1E9PN63 330 aa29.43■■■□□ 2.3
CITED1-210ENST00000454225 TREHO43280 583 aa29.43■■■□□ 2.3
CITED1-210ENST00000454225 DEXIO95424 95 aa29.43■■■□□ 2.3
CITED1-210ENST00000454225 FAM86B2P0C5J1 330 aa29.43■■■□□ 2.3
CITED1-210ENST00000454225 ACTN1P12814 892 aa29.43■■■□□ 2.3
CITED1-210ENST00000454225 MARK3P27448 753 aa29.43■■■□□ 2.3
CITED1-210ENST00000454225 PBX2P40425 430 aa29.43■■■□□ 2.3
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CITED1-210ENST00000454225 SCRN1Q12765 414 aa29.43■■■□□ 2.3
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CITED1-210ENST00000454225 CRYGNQ8WXF5 182 aa29.43■■■□□ 2.3
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CITED1-210ENST00000454225 SH3GLB2Q9NR46 395 aa29.43■■■□□ 2.3
CITED1-210ENST00000454225 NFASCO94856 1347 aa29.43■■■□□ 2.3
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CITED1-210ENST00000454225 AK2P54819 239 aa29.42■■■□□ 2.3
CITED1-210ENST00000454225 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
CITED1-210ENST00000454225 ZNF618Q5T7W0 954 aa29.42■■■□□ 2.3
CITED1-210ENST00000454225 NIPA1Q7RTP0 329 aa29.42■■■□□ 2.3
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CITED1-210ENST00000454225 TIFAQ96CG3 184 aa29.42■■■□□ 2.3
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CITED1-210ENST00000454225 GNAT1P11488 350 aa29.41■■■□□ 2.3
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CITED1-210ENST00000454225 IL17RAQ96F46 866 aa29.41■■■□□ 2.3
CITED1-210ENST00000454225 AIFM3Q96NN9 605 aa29.41■■■□□ 2.3
CITED1-210ENST00000454225 ERAP1Q9NZ08 941 aa29.41■■■□□ 2.3
CITED1-210ENST00000454225 COL6A3P12111 3177 aa29.41■■■□□ 2.3
CITED1-210ENST00000454225 TMEM265A0A087WTH1 108 aa29.4■■■□□ 2.3
CITED1-210ENST00000454225 THPOP40225 353 aa29.4■■■□□ 2.3
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CITED1-210ENST00000454225 LMBR1Q8WVP7 490 aa29.4■■■□□ 2.3
CITED1-210ENST00000454225 UIMC1Q96RL1 719 aa29.4■■■□□ 2.3
CITED1-210ENST00000454225 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa29.4■■■□□ 2.3
CITED1-210ENST00000454225 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa29.4■■■□□ 2.3
CITED1-210ENST00000454225 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa29.39■■■□□ 2.3
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CITED1-210ENST00000454225 PARNO95453 639 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
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CITED1-210ENST00000454225 EMSYQ7Z589 1322 aa29.39■■■□□ 2.3
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CITED1-210ENST00000454225 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
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CITED1-210ENST00000454225 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
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CITED1-210ENST00000454225 MSRAQ9UJ68 235 aa29.38■■■□□ 2.29
CITED1-210ENST00000454225 PCDHA4Q9UN74 947 aa29.38■■■□□ 2.29
CITED1-210ENST00000454225 NRCAMQ92823 1304 aa29.38■■■□□ 2.29
CITED1-210ENST00000454225 CDH23Q9H251 3354 aa29.38■■■□□ 2.29
CITED1-210ENST00000454225 DTNBO60941 627 aa29.37■■■□□ 2.29
CITED1-210ENST00000454225 RABGGTBP53611 331 aa29.37■■■□□ 2.29
CITED1-210ENST00000454225 SETQ01105 290 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
CITED1-210ENST00000454225 MBTPS1Q14703 1052 aa29.37■■■□□ 2.29
CITED1-210ENST00000454225 RAB30Q15771 203 aa29.37■■■□□ 2.29
CITED1-210ENST00000454225 PRR16Q569H4 304 aa29.37■■■□□ 2.29
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CITED1-210ENST00000454225 ADAM17P78536 824 aa29.36■■■□□ 2.29
CITED1-210ENST00000454225 ZNF577Q9BSK1 485 aa29.36■■■□□ 2.29
CITED1-210ENST00000454225 ZNF576Q9H609 170 aa29.36■■■□□ 2.29
CITED1-210ENST00000454225 MYO9BQ13459 2157 aa29.36■■■□□ 2.29
CITED1-210ENST00000454225 RSPH10B2B2RC85 870 aa29.35■■■□□ 2.29
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CITED1-210ENST00000454225 CTSHP09668 335 aa29.35■■■□□ 2.29
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CITED1-210ENST00000454225 NEK4P51957 841 aa29.35■■■□□ 2.29
CITED1-210ENST00000454225 GRIK4Q16099 956 aa29.35■■■□□ 2.29
CITED1-210ENST00000454225 CNKSR3Q6P9H4 555 aa29.35■■■□□ 2.29
CITED1-210ENST00000454225 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa29.35■■■□□ 2.29
CITED1-210ENST00000454225 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
CITED1-210ENST00000454225 BAIAP3O94812 1187 aa29.34■■■□□ 2.29
CITED1-210ENST00000454225 CIITAP33076 1130 aa29.34■■■□□ 2.29
CITED1-210ENST00000454225 BLIDQ8IZY5 108 aa29.34■■■□□ 2.29
CITED1-210ENST00000454225 NECAB1Q8N987 351 aa29.34■■■□□ 2.29
CITED1-210ENST00000454225 MYLIPQ8WY64 445 aa29.34■■■□□ 2.29
CITED1-210ENST00000454225 STK36Q9NRP7 1315 aa29.34■■■□□ 2.29
CITED1-210ENST00000454225 DHX15O43143 795 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CITED1-210ENST00000454225 LARGE1O95461 756 aa29.33■■■□□ 2.29
CITED1-210ENST00000454225 STAT5BP51692 787 aa29.33■■■□□ 2.29
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