RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447232.6

PMS1-215, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, human

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 2,576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMS1-215	ENST00000447232	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232		H3BNC9	293 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	IQCF3	P0C7M6	154 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	DEFB103A	P81534	67 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	COG2	Q14746	738 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	TRIM50	Q86XT4	487 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	MB21D1	Q8N884	522 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	ZNF384	Q8TF68	577 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	SIL1	Q9H173	461 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	SPC25	Q9HBM1	224 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	CD207	Q9UJ71	328 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	ASTN1	O14525	1302 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	SERTM1	A2A2V5	107 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	PIK3R2	O00459	728 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	ATP9B	O43861	1147 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	CYP2C9	P11712	490 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	SDHB	P21912	280 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	KCNJ6	P48051	423 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	HYAL1	Q12794	435 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	EPC2	Q52LR7	807 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	MDFI	Q99750	246 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	MCM3AP	O60318	1980 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	DKK1	O94907	266 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	ATP1A2	P50993	1020 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	BEX3	Q00994	111 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	GPNMB	Q14956	572 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	CD163	Q86VB7	1156 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	ACER1	Q8TDN7	264 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	RUBCN	Q92622	972 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	MMP19	Q99542	508 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	FEZ1	Q99689	392 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	HAUS7	Q99871	368 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	BPTF	Q12830	3046 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	SLC25A27	O95847	323 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	GH2	P01242	217 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	CLCN5	P51795	746 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	DMWD	Q09019	674 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	COASY	Q13057	564 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	ADAM15	Q13444	863 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	ACVR2B	Q13705	512 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	ANGPT1	Q15389	498 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	BEND3	Q5T5X7	828 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	SYT9	Q86SS6	491 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	DCLK2	Q8N568	766 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	TSPYL6	Q8N831	410 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	LPIN2	Q92539	896 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	TRIM11	Q96F44	468 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	SAMD11	Q96NU1	681 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232		M0R2N6	131 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	GRM8	O00222	908 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	LINC01565	O15544	149 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PMS1-215	ENST00000447232	PSMC6	P62333	389 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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