RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439686.6

ARL6IP4-208, Transcript of ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 4, human

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene ARL6IP4, Length 796 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PRR16	Q569H4	304 aa		27.96	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		27.96	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	OXER1	Q8TDS5	423 aa		27.96	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TBCK	Q8TEA7	893 aa		27.96	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	WNT8B	Q93098	351 aa		27.96	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PCYT2	Q99447	389 aa		27.96	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	27.96	■■■□□ 2.07	2e-7	■□□□□ 11
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SDF4	Q9BRK5	362 aa		27.96	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		27.96	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	FOSB	P53539	338 aa		27.95	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		27.95	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TMEM240	Q5SV17	173 aa		27.95	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	GALNT17	Q6IS24	598 aa		27.95	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	LENG9	Q96B70	501 aa		27.95	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		27.95	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	LAMA3	Q16787	3333 aa		27.94	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CCNE2	O96020	404 aa		27.94	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ACTR2	P61160	394 aa		27.94	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ZNF365	Q70YC5	407 aa		27.94	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	IL23A	Q9NPF7	189 aa		27.94	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SETD4	Q9NVD3	440 aa		27.94	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	MARK3	P27448	753 aa		27.93	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	USP11	P51784	963 aa		27.93	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		27.93	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TREH	O43280	583 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	IQCF3	P0C7M6	154 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	RABEP1	Q15276	862 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	RETREG2	Q8NC44	543 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	WASF1	Q92558	559 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	GLG1	Q92896	1179 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	GJA10	Q969M2	543 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	LGR5	O75473	907 aa		27.91	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TDP2	O95551	362 aa		27.91	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	XBP1	P17861	261 aa		27.91	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	HOXC8	P31273	242 aa		27.91	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	INF2	Q27J81	1249 aa		27.91	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	MSH4	O15457	936 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ATG7	O95352	703 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PTK7	Q13308	1070 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	BFSP2	Q13515	415 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	GPNMB	Q14956	572 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	27.9	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PITPNM1	O00562	1244 aa		27.89	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		27.89	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		27.89	■■■□□ 2.06
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	FAM205C	A6NFA0	338 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	FGB	P02675	491 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CKB	P12277	381 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CYP3A7	P24462	503 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ADAM17	P78536	824 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NR5A1	Q13285	461 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SERINC5	Q86VE9	423 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SZT2	Q5T011	3432 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	STAT5B	P51692	787 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CAGE1	Q8TC20	777 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	BACH2	Q9BYV9	841 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SELP	P16109	830 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	GUCY1B3	Q02153	619 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PLCB4	Q15147	1175 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	LETM2	Q2VYF4	491 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686		Q4G0T1	1027 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	RASIP1	Q5U651	963 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	KRT40	Q6A162	431 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TNFRSF25	Q93038	417 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	MBOAT7	Q96N66	472 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	AZI2	Q9H6S1	392 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	EMSY	Q7Z589	1322 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	BTBD18	B2RXH4	712 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	KRT2	P35908	639 aa		27.85	■■■□□ 2.05

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms