RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428534.1

GLI3-202, Transcript of GLI family zinc finger 3, humanhuman

TSL 4

Gene GLI3, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3-202ENST00000428534 TDP2O95551 362 aa26.53■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa26.53■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 SP4Q02446 784 aa26.53■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 TRIM60Q495X7 471 aa26.53■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 SLC5A5Q92911 643 aa26.53■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 TEKT3Q9BXF9 490 aa26.53■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa26.53■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 AZI2Q9H6S1 392 aa26.53■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 BCAS3Q9H6U6 928 aa26.53■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 LGALS2P05162 132 aa26.52■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 PSEN2P49810 448 aa26.52■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 SESTD1Q86VW0 696 aa26.52■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 SLFN12Q8IYM2 578 aa26.52■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 C7orf61Q8IZ16 206 aa26.52■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 C16orf70Q9BSU1 422 aa26.52■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa26.51■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 DHX15O43143 795 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 ATG7O95352 703 aa26.51■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 SFNP31947 248 aa26.51■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 SLC26A2P50443 739 aa26.51■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 ACTR2P61160 394 aa26.51■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 TLE2Q04725 743 aa26.51■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 MFSD10Q14728 455 aa26.51■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 NBPF20Q3BBV1 942 aa26.51■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 LRCH2Q5VUJ6 765 aa26.51■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 MCTP1Q6DN14 999 aa26.51■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa26.51■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 C7orf31Q8N865 590 aa26.51■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 EMSYQ7Z589 1322 aa26.5■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 HAS3O00219 553 aa26.5■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 PSMC6P62333 389 aa26.5■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 KIAA0753Q2KHM9 967 aa26.5■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 FAM160B1Q5W0V3 765 aa26.5■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 RDM1Q8NG50 284 aa26.5■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 KAT2BQ92831 832 aa26.5■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 GLG1Q92896 1179 aa26.5■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 ERAP1Q9NZ08 941 aa26.5■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 WDR64B1ANS9 1081 aa26.49■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 CLTBP09497 229 aa26.49■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 ZNF286BP0CG31 522 aa26.49■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 JAK3P52333 1124 aa26.49■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 BECN1Q14457 450 aa26.49■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 FAM47CQ5HY64 1035 aa26.49■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa26.49■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 ETNPPLQ8TBG4 499 aa26.49■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 KCNMB3Q9NPA1 279 aa26.49■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa26.49■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 GRIN2DO15399 1336 aa26.48■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 A0A1W2PPC1 479 aa26.48■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 LGR5O75473 907 aa26.48■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 PSMD10O75832 226 aa26.48■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 PSAPP07602 524 aa26.48■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 GNAT1P11488 350 aa26.48■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 FAM126BQ8IXS8 530 aa26.48■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 FAM205CA6NFA0 338 aa26.47■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 SLC37A4O43826 429 aa26.47■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 NEMFO60524 1076 aa26.47■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 STAT5BP51692 787 aa26.47■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 CHMP4BP1P59074 171 aa26.47■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 RILPL1Q5EBL4 403 aa26.47■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 ABHD15Q6UXT9 468 aa26.47■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 SAMM50Q9Y512 469 aa26.47■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa26.46■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 BACH1O14867 736 aa26.46■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 CALCRLQ16602 461 aa26.46■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 BRAPQ7Z569 592 aa26.46■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 AFAP1L1Q8TED9 768 aa26.46■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 LRCH3Q96II8 777 aa26.46■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 TMEM39AQ9NV64 488 aa26.46■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 NOD1Q9Y239 953 aa26.46■■□□□ 1.83
GLI3-202ENST00000428534 CCNE2O96020 404 aa26.45■■□□□ 1.82
GLI3-202ENST00000428534 CD4P01730 458 aa26.45■■□□□ 1.82
GLI3-202ENST00000428534 FAAP100Q0VG06 881 aa26.45■■□□□ 1.82
GLI3-202ENST00000428534 TTC38Q5R3I4 469 aa26.45■■□□□ 1.82
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GLI3-202ENST00000428534 ZNF302Q9NR11 478 aa26.45■■□□□ 1.82
GLI3-202ENST00000428534 DISC1Q9NRI5 854 aa26.45■■□□□ 1.82
GLI3-202ENST00000428534 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa26.45■■□□□ 1.82
GLI3-202ENST00000428534 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa26.45■■□□□ 1.82
GLI3-202ENST00000428534 KIF28PB7ZC32 967 aa26.44■■□□□ 1.82
GLI3-202ENST00000428534 SYN1P17600 705 aa26.44■■□□□ 1.82
GLI3-202ENST00000428534 ATP2B1P20020 1258 aa26.44■■□□□ 1.82
GLI3-202ENST00000428534 POTEDQ86YR6 584 aa26.44■■□□□ 1.82
GLI3-202ENST00000428534 HDAC6Q9UBN7 1215 aa26.44■■□□□ 1.82
GLI3-202ENST00000428534 NRCAMQ92823 1304 aa26.43■■□□□ 1.82
GLI3-202ENST00000428534 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
GLI3-202ENST00000428534 KIAA0355O15063 1070 aa26.43■■□□□ 1.82
GLI3-202ENST00000428534 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP26.43■■□□□ 1.82
GLI3-202ENST00000428534 SYT1P21579 422 aa26.43■■□□□ 1.82
GLI3-202ENST00000428534 MCM7P33993 719 aa26.43■■□□□ 1.82
GLI3-202ENST00000428534 PPP2R5CQ13362 524 aa26.43■■□□□ 1.82
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