RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP27.05■■□□□ 1.92
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FAAP20-206ENST00000414253 AOC3Q16853 763 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 SKIDA1Q1XH10 827 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 QRICH1Q2TAL8 776 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 ALS2CLQ60I27 953 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 SIAH1Q8IUQ4 282 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 CAVIN3Q969G5 261 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 NUDT12Q9BQG2 462 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 MMRN2Q9H8L6 949 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
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FAAP20-206ENST00000414253 PAFAH1B1P43034 410 aa27.05■■□□□ 1.92
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FAAP20-206ENST00000414253 SEPT2Q15019 361 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 KRT79Q5XKE5 535 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 DEFB132Q7Z7B7 95 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 SNX29Q8TEQ0 813 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 HAS1Q92839 578 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 LRRC53A6NM62 1247 aa27.04■■□□□ 1.92
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FAAP20-206ENST00000414253 CCDC155Q8N6L0 562 aa27.04■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 C7orf43Q8WVR3 580 aa27.04■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 CNKSR1Q969H4 720 aa27.04■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 GRIN2DO15399 1336 aa27.04■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 EBAG9O00559 213 aa27.04■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 CXCR5P32302 372 aa27.04■■□□□ 1.92
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FAAP20-206ENST00000414253 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 RAD54LQ92698 747 aa27.04■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa27.03■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 ICE2Q659A1 982 aa27.03■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 RUFY1Q96T51 708 aa27.03■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 PSMB7Q99436 277 aa27.03■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa27.03■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa27.03■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 HSF2BPO75031 334 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 GNGT1P63211 74 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM119Q4V9L6 283 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM179Q6ZVK1 233 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 UNC13DQ70J99 1090 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 BCAS4Q8TDM0 211 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 BAP1Q92560 729 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 EHD2Q9NZN4 543 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 SALL4Q9UJQ4 1053 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 USP17L15C9J2P7 530 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 USP17L13C9JLJ4 530 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 USP17L11C9JVI0 530 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 USP17L18D6R9N7 530 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 USP17L22D6RA61 530 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 USP17L17D6RBQ6 530 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 USP17L19D6RCP7 530 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 USP17L20D6RJB6 530 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 ICA1Q05084 483 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 USP17L24Q0WX57 530 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 NNTQ13423 1086 aa27.02■■□□□ 1.92
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FAAP20-206ENST00000414253 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 C8orf74Q6P047 294 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 USP17L6PQ6QN14 398 aa27.02■■□□□ 1.92
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FAAP20-206ENST00000414253 GLT8D2Q9H1C3 349 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-206ENST00000414253 SHTN1A0MZ66 631 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-206ENST00000414253 SKOR1P84550 965 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-206ENST00000414253 DYMQ7RTS9 669 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-206ENST00000414253 KCNK18Q7Z418 384 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-206ENST00000414253 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-206ENST00000414253 GJA10Q969M2 543 aa27.01■■□□□ 1.91
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FAAP20-206ENST00000414253 GDF11O95390 407 aa27.01■■□□□ 1.91
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FAAP20-206ENST00000414253 TSKSQ9UJT2 592 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-206ENST00000414253 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa27■■□□□ 1.91
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FAAP20-206ENST00000414253 LRRC63Q05C16 580 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-206ENST00000414253 ABCB5Q2M3G0 1257 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-206ENST00000414253 TUBB8Q3ZCM7 444 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-206ENST00000414253 TTMPQ5BVD1 217 aa27■■□□□ 1.91
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FAAP20-206ENST00000414253 PDXDC1Q6P996 788 aa27■■□□□ 1.91
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FAAP20-206ENST00000414253 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
FAAP20-206ENST00000414253 PCDHA12Q9UN75 941 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-206ENST00000414253 F5H6K3 240 aa27■■□□□ 1.91
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FAAP20-206ENST00000414253 KLRC3Q07444 240 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-206ENST00000414253 ECM1Q16610 540 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-206ENST00000414253 ARL8AQ96BM9 186 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-206ENST00000414253 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
FAAP20-206ENST00000414253 FAM169AQ9Y6X4 670 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-206ENST00000414253 RNF14Q9UBS8 474 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-206ENST00000414253 RASSF7Q02833 373 aa26.98■■□□□ 1.91
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