RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 PSMC4P43686 418 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 RARSP54136 660 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 POLE2P56282 527 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 CCNG2Q16589 344 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 KCTD16Q68DU8 428 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 LVRNQ6Q4G3 990 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 ERICH1Q86X53 443 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 KLHDC4Q8TBB5 520 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 GBA3Q9H227 469 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-202ENST00000380828 DPPA5A6NC42 116 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 TFPTP0C1Z6 253 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 C7P10643 843 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 KRT83P78385 493 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 FAPQ12884 760 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 IFNL1Q8IU54 200 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 TMTC1Q8IUR5 882 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 OR8H2Q8N162 312 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CNNM3Q8NE01 707 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC110Q8TBZ0 833 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 NUP58Q9BVL2 599 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ATPIF1Q9UII2 106 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF711Q9Y462 761 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 DISP2A7MBM2 1401 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 NDC80O14777 642 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 FGFR4P22455 802 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PTGS1P23219 599 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ACADSBP45954 432 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 MTTPP55157 894 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 KDSRQ06136 332 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 IPMKQ8NFU5 416 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 OSCP1Q8WVF1 389 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 HOOK2Q96ED9 719 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CNDP1Q96KN2 507 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 MOCS1Q9NZB8 636 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 STAG3Q9UJ98 1225 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CFL2Q9Y281 166 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 GPRASP1Q5JY77 1395 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ABLIM1O14639 778 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PENKP01210 267 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 POU2F1P14859 743 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 EPB42P16452 691 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CDC27P30260 824 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGDIBP52566 201 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 AP3M2P53677 418 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 GABREP78334 506 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 MYO1EQ12965 1108 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 RAPGEF1Q13905 1077 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC44A4Q53GD3 710 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF570Q96NI8 536 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKRD27Q96NW4 1050 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 KIF28PB7ZC32 967 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM127O75204 238 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PRKACAP17612 351 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 TUBP50607 506 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PDE3AQ14432 1141 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 DGKHQ86XP1 1220 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP2R3CQ969Q6 453 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CEP95Q96GE4 821 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 COG3Q96JB2 828 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 CARD11Q9BXL7 1154 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 SERHL2Q9H4I8 314 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM206Q9H813 350 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 LGR6Q9HBX8 967 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 TNS3Q68CZ2 1445 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 BCL9LQ86UU0 1499 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 USP27XA6NNY8 438 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 GREM1O60565 184 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 TADA3O75528 432 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 APOEP02649 317 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 ALAS1P13196 640 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 PLCG2P16885 1265 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 GSTO1P78417 241 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 DR1Q01658 176 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-202ENST00000380828 SNCBQ16143 134 aa7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms