RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368602.3

TRAPPC3L-202, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-202ENST00000368602 SAMD3Q8N6K7 520 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 GTF3C6Q969F1 213 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 KIFC2Q96AC6 838 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 TOX2Q96NM4 488 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 SPZ1Q9BXG8 430 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 TEX13BQ9BXU2 312 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 NRBP1Q9UHY1 535 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 TAF6LQ9Y6J9 622 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 WASF2Q9Y6W5 498 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 MUC3AQ02505 3323 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 CHD9Q3L8U1 2897 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 STK36Q9NRP7 1315 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 RFXAPO00287 272 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 IFNAR1P17181 557 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 PSMC6P62333 389 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 CNTN2Q02246 1040 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 TFF2Q03403 129 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 ZNF543Q08ER8 600 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 GNASQ5JWF2 1037 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 MCTP2Q6DN12 878 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 CXCL17Q6UXB2 119 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 BTNL9Q6UXG8 535 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 ARMCX2Q7L311 632 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 EEPD1Q7L9B9 569 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 RASGRP2Q7LDG7 609 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 MICU3Q86XE3 530 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 FAM126BQ8IXS8 530 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 ANKRD35Q8N283 1001 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 ASB2Q96Q27 587 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 THEGQ9P2T0 379 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 ASTN1O14525 1302 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 KLRF2D3W0D1 207 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 ARVCFO00192 962 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 CTAGE5O15320 804 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 NMT2O60551 498 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 CDK7P50613 346 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 KCNQ1P51787 676 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 APOBRQ0VD83 1088 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 CUL4AQ13619 759 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 RASIP1Q5U651 963 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 CHST3Q7LGC8 479 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 TMEM199Q8N511 208 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 SCLYQ96I15 445 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 TMX3Q96JJ7 454 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 TRPV6Q9H1D0 765 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 CERS4Q9HA82 394 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 INCENPQ9NQS7 918 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 TPCN1Q9ULQ1 816 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 ZBBXA8MT70 800 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 ZBED4O75132 1171 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 DEXIO95424 95 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 GJA9P57773 515 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 IKQ13123 557 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 CCDC96Q2M329 555 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 KRT40Q6A162 431 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 GALNT17Q6IS24 598 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 TMTC3Q6ZXV5 915 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 CCDC148Q8NFR7 591 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 LRRN4Q8WUT4 740 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 AGBL1Q96MI9 1066 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 KATNBL1Q9H079 304 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 WNT8AQ9H1J5 351 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 HIPK3Q9H422 1215 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 SH3GLB2Q9NR46 395 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 PDGFCQ9NRA1 345 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 MSRAQ9UJ68 235 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 MTMR7Q9Y216 660 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 GRIN2DO15399 1336 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 REV3LO60673 3130 aa9.48□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 ATP2A1O14983 1001 aa9.48□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 TLR3O15455 904 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 B4GALT4O60513 344 aa9.48□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 CD4P01730 458 aa9.48□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 FGBP02675 491 aa9.48□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-202ENST00000368602 CPA1P15085 419 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms