RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 MRIQ9BWK5 157 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 KCND1Q9NSA2 647 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 FBXO21O94952 628 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 FGRP09769 529 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 CSF2RBP32927 897 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRK-202ENST00000368205 CD276Q5ZPR3 534 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 LBX2Q6XYB7 198 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 USP53Q70EK8 1073 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
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PTPRK-202ENST00000368205 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-202ENST00000368205 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-202ENST00000368205 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
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PTPRK-202ENST00000368205 IFNL2Q8IZJ0 200 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-202ENST00000368205 LMF1Q96S06 567 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-202ENST00000368205 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF839A8K0R7 811 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-202ENST00000368205 LTFP02788 710 aa6.45□□□□□ -1.38
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PTPRK-202ENST00000368205 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRK-202ENST00000368205 H0Y858 1186 aa6.44□□□□□ -1.38
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PTPRK-202ENST00000368205 STPG3Q8N7X2 389 aa6.44□□□□□ -1.38
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PTPRK-202ENST00000368205 GPR155Q7Z3F1 870 aa6.43□□□□□ -1.38
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PTPRK-202ENST00000368205 IFNL3Q8IZI9 196 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRK-202ENST00000368205 EDAQ92838 391 aa6.42□□□□□ -1.38
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PTPRK-202ENST00000368205 PRODHO43272 600 aa6.41□□□□□ -1.38
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PTPRK-202ENST00000368205 SOD2P04179 222 aa6.41□□□□□ -1.38
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PTPRK-202ENST00000368205 ARID5AQ03989 594 aa6.41□□□□□ -1.38
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PTPRK-202ENST00000368205 MIIPQ5JXC2 388 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRK-202ENST00000368205 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRK-202ENST00000368205 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRK-202ENST00000368205 KCNJ15Q99712 375 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRK-202ENST00000368205 TINF2Q9BSI4 451 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRK-202ENST00000368205 CARD11Q9BXL7 1154 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-202ENST00000368205 KLF10Q13118 480 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRK-202ENST00000368205 FOXE3Q13461 319 aa6.4□□□□□ -1.38
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