RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364415.1

5S_rRNA.1-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 116 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 CASTP20810 708 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 EDNRBP24530 442 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 HOXC13P31276 330 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 MTHFRP42898 656 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 ITIH3Q06033 890 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 CSRP2Q16527 193 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 CES5AQ6NT32 575 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 RASGRP2Q7LDG7 609 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 PJA1Q8NG27 643 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 KIF12Q96FN5 646 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 CCDC17Q96LX7 622 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 NECTIN4Q96NY8 510 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 SCNM1Q9BWG6 230 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 CLIP2Q9UDT6 1046 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 SWAP70Q9UH65 585 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 GMEB2Q9UKD1 530 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 FBXO4Q9UKT5 387 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 USTQ9Y2C2 406 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 SDK1Q7Z5N4 2213 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 NAV1Q8NEY1 1877 aa4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 KIAA1671Q9BY89 1806 aa4.46□□□□□ -1.69
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 TMEM8BA6NDV4 472 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 TMEM232C9JQI7 657 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 LAMTOR5O43504 91 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 SORBS3O60504 671 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 F2P00734 622 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 RETP07949 1114 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 TDGF1P13385 188 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 CD72P21854 359 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 HOXC8P31273 242 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 ATP8B2P98198 1209 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 FZD5Q13467 585 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 LPIN1Q14693 890 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 TPRNQ4KMQ1 711 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 FAM26DQ5JW98 314 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 ATAT1Q5SQI0 421 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 TTC39AQ5SRH9 613 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 C12orf60Q5U649 245 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 IL31Q6EBC2 164 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 KIAA1841Q6NSI8 718 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 TMC5Q6UXY8 1006 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 SLC30A10Q6XR72 485 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 C16orf86Q6ZW13 317 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 STK11IPQ8N1F8 1099 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 LCORLQ8N3X6 602 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 SCFD2Q8WU76 684 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 ATP6V0A1Q93050 837 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 CRELD1Q96HD1 420 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 TCF25Q9BQ70 676 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 RNPEPQ9H4A4 650 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 BCAS3Q9H6U6 928 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 EHMT1Q9H9B1 1298 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 TMEM260Q9NX78 707 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 NYAP2Q9P242 653 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 FEM1BQ9UK73 627 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 SPTA1P02549 2419 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 RAD50Q92878 1312 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 CACNA1FO60840 1977 aa4.45□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa4.45□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa4.45□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 SHISA7A6NL88 538 aa4.45□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa4.45□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 HRO43593 1189 aa4.45□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 GH1P01241 217 aa4.45□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 CHGBP05060 677 aa4.45□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 EPCAMP16422 314 aa4.45□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 RFX1P22670 979 aa4.45□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 CALML3P27482 149 aa4.45□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 PBX3P40426 434 aa4.45□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 LIMK1P53667 647 aa4.45□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 STARD6P59095 220 aa4.45□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 UBE3AQ05086 875 aa4.45□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 RALBP1Q15311 655 aa4.45□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 DGKDQ16760 1214 aa4.45□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 TKFCQ3LXA3 575 aa4.45□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 FAM102BQ5T8I3 360 aa4.45□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 LAIR1Q6GTX8 287 aa4.45□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 XRRA1Q6P2D8 792 aa4.45□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa4.45□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 SEPT14Q6ZU15 432 aa4.45□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 GLIS3Q8NEA6 775 aa4.45□□□□□ -1.7
5S_rRNA.1-201ENST00000364415 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms