RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 CCNE2O96020 404 aa31.25■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 ACTR2P61160 394 aa31.25■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 GRIN1Q05586 938 aa31.25■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 MIER3Q7Z3K6 550 aa31.25■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 PPTC7Q8NI37 304 aa31.25■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 DISC1Q9NRI5 854 aa31.25■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 ADALQ6DHV7 355 aa31.25■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 ERMNQ8TAM6 284 aa31.25■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP31.25■■■□□ 2.593e-6■■■■□ 19.8
GIPC1-201ENST00000345425 SPC25Q9HBM1 224 aa31.25■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 HSDL1Q3SXM5 330 aa31.24■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 SEPT1Q8WYJ6 367 aa31.24■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa31.24■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa31.23■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 PTGS1P23219 599 aa31.23■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 ARMC5Q96C12 935 aa31.23■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 GPR20Q99678 358 aa31.23■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 EML1O00423 815 aa31.22■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 EPHA7Q15375 998 aa31.22■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 HAUS3Q68CZ6 603 aa31.22■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa31.22■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 UNC93B1Q9H1C4 597 aa31.22■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 ATG7O95352 703 aa31.22■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 PSAPP07602 524 aa31.22■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 CPT1AP50416 773 aa31.22■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 GJA9P57773 515 aa31.22■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 KRT79Q5XKE5 535 aa31.22■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 AFG1LQ8WV93 481 aa31.22■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF333Q96JL9 665 aa31.22■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa31.22■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 NEK9Q8TD19 979 aa31.21■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa31.21■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 CENPFP49454 3210 aa31.21■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 CCL5P13501 91 aa31.2■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 TXLNAP40222 546 aa31.2■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 UBA7P41226 1012 aa31.2■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 ABHD15Q6UXT9 468 aa31.2■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 RNF208Q9H0X6 261 aa31.2■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.59
GIPC1-201ENST00000345425 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa31.2■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 A6NJR5 290 aa31.2■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa31.2■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 MTFR1Q15390 333 aa31.2■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 SPECC1Q5M775 1068 aa31.2■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 MCOLN1Q9GZU1 580 aa31.2■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1W2PQ27 194 aa31.19■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1W2PQ64 194 aa31.19■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1W2PQD8 194 aa31.19■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 POTEFA5A3E0 1075 aa31.19■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 PP2D1A8MPX8 630 aa31.19■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 MMP3P08254 477 aa31.19■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 NKX3-2P78367 333 aa31.19■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 SNX29Q8TEQ0 813 aa31.19■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 TELO2Q9Y4R8 837 aa31.19■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 PPFIA4O75335 1185 aa31.18■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 CDC25AP30304 524 aa31.18■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 DGKDQ16760 1214 aa31.18■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 SHC4Q6S5L8 630 aa31.18■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 SLC26A4O43511 780 aa31.17■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 MYCP01106 439 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 P4HBP07237 508 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 CMA1P23946 247 aa31.17■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 RESP18Q5W5W9 173 aa31.17■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 LHX8Q68G74 356 aa31.17■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 CABP7Q86V35 215 aa31.17■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 EPSTI1Q96J88 318 aa31.17■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 CCSER1Q9C0I3 900 aa31.17■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 FAM13BQ9NYF5 915 aa31.17■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 BACH1O14867 736 aa31.17■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 ADAMTS4O75173 837 aa31.17■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 PGK1P00558 417 aa31.17■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 RPA1P27694 616 aa31.17■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 FAM160B1Q5W0V3 765 aa31.17■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 AZI2Q9H6S1 392 aa31.17■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 TUFT1Q9NNX1 390 aa31.17■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa31.17■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa31.16■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 HSD17B14Q9BPX1 270 aa31.16■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 EMSYQ7Z589 1322 aa31.16■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 FRMPD3Q5JV73 1810 aa31.16■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 ZEB2O60315 1214 aa31.15■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP31.15■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 SWSAP1Q6NVH7 229 aa31.15■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 RNF180Q86T96 592 aa31.15■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 RASSF8Q8NHQ8 419 aa31.15■■■□□ 2.58
GIPC1-201ENST00000345425 ATP6V0A1Q93050 837 aa31.15■■■□□ 2.58
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