RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319107.8

RALGPS1-202, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-202ENST00000319107 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 LRCH2Q5VUJ6 765 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 AFG1LQ8WV93 481 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 HAS1Q92839 578 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 UIMC1Q96RL1 719 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 TEKT3Q9BXF9 490 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 GAS7O60861 476 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 PSMD10O75832 226 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 GJA10Q969M2 543 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 GPR20Q99678 358 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 ELP1O95163 1332 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 ZEB2O60315 1214 aa22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 OR52Z1P0C646 297 aa22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 KRT76Q01546 638 aa22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 SP4Q02446 784 aa22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 GNASQ5JWF2 1037 aa22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 MTMR9Q96QG7 549 aa22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 MOXD2PA6NHM9 499 aa22.79■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.79■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 PHF24Q9UPV7 400 aa22.79■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.79■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 LAD1O00515 517 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 MARCH6O60337 910 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 CCNE2O96020 404 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 ASGR1P07306 291 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 SYN1P17600 705 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 ACTR2P61160 394 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 NUCB2P80303 420 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 KCNA10Q16322 511 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 DGKDQ16760 1214 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 B3GNT9Q6UX72 402 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 UNC45AQ9H3U1 944 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 VAV3Q9UKW4 847 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 KPNA6O60684 536 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 BMP15O95972 392 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 MYL3P08590 195 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 ACLYP53396 1101 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 PTGDRQ13258 359 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 PPP2R5CQ13362 524 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 EMSYQ7Z589 1322 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-202ENST00000319107 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 PPFIA4O75335 1185 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 ATG7O95352 703 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 PRPHP41219 470 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 JAK3P52333 1124 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 USP28Q96RU2 1077 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 A0A1W2PQY0 241 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 WDR64B1ANS9 1081 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 CHMP2AO43633 222 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 LGALS2P05162 132 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF286BP0CG31 522 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 SFNP31947 248 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 TXKP42681 527 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 RTP1P59025 263 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 RDM1Q8NG50 284 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 FERMT2Q96AC1 680 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-202ENST00000319107 CLIC4Q9Y696 253 aa22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms