RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 RASA1P20936 1047 aa27.03■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 CDK17Q00537 523 aa27.03■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 RETREG2Q8NC44 543 aa27.03■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa27.03■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 THAP9Q9H5L6 903 aa27.03■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa27.03■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 GOLGA6L10A6NI86 522 aa27.03■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 BTDP43251 543 aa27.03■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 NBPF20Q3BBV1 942 aa27.03■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 WDR66Q8TBY9 1149 aa27.03■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 NSMCE1Q8WV22 266 aa27.03■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 SPDL1Q96EA4 605 aa27.03■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 TRIM47Q96LD4 638 aa27.03■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa27.03■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 KIF9Q9HAQ2 790 aa27.03■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 DISC1Q9NRI5 854 aa27.03■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 SALL4Q9UJQ4 1053 aa27.03■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 KLHL33A6NCF5 533 aa27.02■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 C5orf60A6NFR6 353 aa27.02■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 KLRF2D3W0D1 207 aa27.02■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 M0R2N6 131 aa27.02■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 STXBP3O00186 592 aa27.02■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 GRAPQ13588 217 aa27.02■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 NBPF9Q3BBW0 867 aa27.02■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 WHAMMQ8TF30 809 aa27.02■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 CCT6BQ92526 530 aa27.02■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 CFAP221Q4G0U5 840 aa27.01■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 CUL5Q93034 780 aa27.01■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 UBA5Q9GZZ9 404 aa27.01■■□□□ 1.92
PKDCC-201ENST00000294964 MYO1EQ12965 1108 aa27.01■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 LETM2Q2VYF4 491 aa27.01■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 LMBR1Q8WVP7 490 aa27.01■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa27.01■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 LONP1P36776 959 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa27■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 OR2W6PQ8NHA6 318 aa27■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 EBF2Q9HAK2 575 aa27■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 UFL1O94874 794 aa27■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 BAG3O95817 575 aa27■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 MYZAPP0CAP1 466 aa27■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 UBA7P41226 1012 aa27■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 KIF11P52732 1056 aa27■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 CRY2Q49AN0 593 aa27■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 TAX1BP1Q86VP1 789 aa26.99■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 TATDN2Q93075 761 aa26.99■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 PLCB1Q9NQ66 1216 aa26.99■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 CDK8P49336 464 aa26.99■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 CLEC10AQ8IUN9 316 aa26.99■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 SLC16A10Q8TF71 515 aa26.99■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 RAPGEF5Q92565 580 aa26.99■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 HPS3Q969F9 1004 aa26.99■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 KRT12Q99456 494 aa26.99■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 EYA3Q99504 573 aa26.99■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 BATF3Q9NR55 127 aa26.99■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 BARHL2Q9NY43 387 aa26.99■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 NAPAP54920 295 aa26.98■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa26.98■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 PEX19P40855 299 aa26.98■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 PPP1R7Q15435 360 aa26.98■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 GPIHBP1Q8IV16 184 aa26.98■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 KDM4CQ9H3R0 1056 aa26.98■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 GHRP10912 638 aa26.97■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF804AQ7Z570 1209 aa26.97■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.97■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 PHF20L1A8MW92 1017 aa26.97■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP26.97■■□□□ 1.915e-7■■■□□ 17.1
PKDCC-201ENST00000294964 PPIP5K2O43314 1243 aa26.97■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 ZBTB7AO95365 584 aa26.97■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 HSD17B3P37058 310 aa26.97■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 LRIG3Q6UXM1 1119 aa26.97■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 P3H4Q92791 437 aa26.97■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 MTMR8Q96EF0 704 aa26.97■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 CD209Q9NNX6 404 aa26.97■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 TMEM260Q9NX78 707 aa26.97■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 TTI2Q6NXR4 508 aa26.96■■□□□ 1.91
PKDCC-201ENST00000294964 SLC39A2Q9NP94 309 aa26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.9 ms