RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249377.4

LRRC17-201, Transcript of leucine rich repeat containing 17, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC17, Length 2,002 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17-201ENST00000249377 AIPL1Q9NZN9 384 aa14.93□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 GOLGA6L10A6NI86 522 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 KLRF2D3W0D1 207 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 E7EVH7 732 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 CHUKO15111 745 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 TSPY3P0CV98 308 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 TSPY8P0CW00 308 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 RFC4P35249 363 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 MARSP56192 900 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 CCDC40Q4G0X9 1142 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 TMEM119Q4V9L6 283 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 GPATCH11Q8N954 259 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 TBC1D5Q92609 795 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 KLC4Q9NSK0 619 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 A0A087X0T9 212 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 ESYT2A0FGR8 921 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 PAEPP09466 180 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 FAM228BP0C875 321 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 MYZAPP0CAP1 466 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 SMARCA1P28370 1054 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 TXKP42681 527 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 IFT88Q13099 833 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 BIRC3Q13489 604 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 GLIS3Q8NEA6 775 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 ACTRT1Q8TDG2 376 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 DDX12PQ92771 950 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 LRRC45Q96CN5 670 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 CEP63Q96MT8 703 aa14.92□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 C5orf60A6NFR6 353 aa14.91□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 TRAPPC3O43617 180 aa14.91□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 ZPR1O75312 459 aa14.91□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 DNA2P51530 1060 aa14.91□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 ZNF844Q08AG5 666 aa14.91□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 PDIA5Q14554 519 aa14.91□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 SEPT2Q15019 361 aa14.91□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 CALCRLQ16602 461 aa14.91□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.91□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.91□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 ERFEQ4G0M1 354 aa14.91□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa14.91□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 PBKQ96KB5 322 aa14.91□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 PACSIN1Q9BY11 444 aa14.91□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 MKNK2Q9HBH9 465 aa14.91□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 MYH4Q9Y623 1939 aa14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 GMNCA6NCL1 334 aa14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 KIF4AO95239 1232 aa14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 GNA14O95837 355 aa14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 GOLGA8HP0CJ92 632 aa14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 USP11P51784 963 aa14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 TMEM266Q2M3C6 531 aa14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 C10orf76Q5T2E6 689 aa14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 AGBL2Q5U5Z8 902 aa14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 RUFY4Q6ZNE9 571 aa14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 KLHL7Q8IXQ5 586 aa14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 GANQ9H2C0 597 aa14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 ATP8B3O60423 1300 aa14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 C21orf2O43822 256 aa14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 CCDC172P0C7W6 258 aa14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 ERCC3P19447 782 aa14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 HPDP32754 393 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 COASYQ13057 564 aa14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 LRRC41Q15345 812 aa14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 RPS6KA1Q15418 735 aa14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 SOGA3Q5TF21 947 aa14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 MSL1Q68DK7 614 aa14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 TAF4BQ92750 862 aa14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 RAB34Q9BZG1 259 aa14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 SLC40A1Q9NP59 571 aa14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 STX8Q9UNK0 236 aa14.9□□□□□ -0.02
LRRC17-201ENST00000249377 QSER1Q2KHR3 1735 aa14.89□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 EDIL3O43854 480 aa14.89□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 RASA1P20936 1047 aa14.89□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 KLHL30Q0D2K2 578 aa14.89□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
LRRC17-201ENST00000249377 CCDC121Q6ZUS5 278 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms