RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.3■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 MYL1P05976 194 aa22.3■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.3■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.3■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 MAP3K10Q02779 954 aa22.3■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.3■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.3■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 TTI2Q6NXR4 508 aa22.3■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.3■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 CUL5Q93034 780 aa22.3■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 RHOBTB3O94955 611 aa22.29■■□□□ 1.16
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VGF-201ENST00000249330 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 KLRC4O43908 158 aa22.29■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 VAV2P52735 878 aa22.29■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 SEMA3FQ13275 785 aa22.29■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 SKIDA1Q1XH10 827 aa22.29■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.29■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 FZD1Q9UP38 647 aa22.29■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 TDP2O95551 362 aa22.28■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 PPFIA1Q13136 1202 aa22.28■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 TNFAIP1Q13829 316 aa22.28■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 SPA17Q15506 151 aa22.28■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 POTEDQ86YR6 584 aa22.28■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.28■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.28■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 RUBCNQ92622 972 aa22.28■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.28■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 JRKLQ9Y4A0 524 aa22.28■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 DUSP10Q9Y6W6 482 aa22.28■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 CPP00450 1065 aa22.28■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 UBA7P41226 1012 aa22.28■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
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VGF-201ENST00000249330 CYP27A1Q02318 531 aa22.28■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.28■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 TADA2BQ86TJ2 420 aa22.28■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 SNX12Q9UMY4 172 aa22.28■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 KLK7P49862 253 aa22.27■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.162e-7■■■■■ 43.3
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VGF-201ENST00000249330 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.27■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 PLIN2Q99541 437 aa22.27■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.27■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 SLC37A4O43826 429 aa22.27■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 TACC1O75410 805 aa22.27■■□□□ 1.16
VGF-201ENST00000249330 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
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VGF-201ENST00000249330 CDK17Q00537 523 aa22.27■■□□□ 1.16
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VGF-201ENST00000249330 DGKZQ13574 1117 aa22.26■■□□□ 1.15
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VGF-201ENST00000249330 EPS15P42566 896 aa22.26■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 TECP42680 631 aa22.26■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.26■■□□□ 1.15
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VGF-201ENST00000249330 CREG2Q8IUH2 290 aa22.25■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 P2RX5Q93086 422 aa22.25■■□□□ 1.15
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VGF-201ENST00000249330 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.25■■□□□ 1.15
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VGF-201ENST00000249330 A0A1W2PQJ5 194 aa22.25■■□□□ 1.15
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VGF-201ENST00000249330 CCNE1P24864 410 aa22.25■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 TXKP42681 527 aa22.25■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 MMP14P50281 582 aa22.25■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 ITIH3Q06033 890 aa22.25■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.24■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 MEIS2O14770 477 aa22.24■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 OPA1O60313 960 aa22.24■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 INPP5BP32019 993 aa22.24■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 FIGNQ5HY92 759 aa22.24■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 FKBP15Q5T1M5 1219 aa22.24■■□□□ 1.15
VGF-201ENST00000249330 GJA10Q969M2 543 aa22.24■■□□□ 1.15
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