RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 VIMP08670 466 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.23■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 ARID5AQ03989 594 aa23.23■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 ANKS1AQ92625 1134 aa23.23■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 ECT2Q9H8V3 914 aa23.23■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 EVI5O60447 810 aa23.22■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 ITGA4P13612 1032 aa23.22■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 RASGRF1Q13972 1273 aa23.22■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 TANGO6Q9C0B7 1094 aa23.22■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 STK38LQ9Y2H1 464 aa23.22■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.22■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 A0A087X0T9 212 aa23.22■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 A6NHS1 94 aa23.22■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 TTI1O43156 1089 aa23.22■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 KIF4AO95239 1232 aa23.22■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 SHBGP04278 402 aa23.22■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 FAM228BP0C875 321 aa23.22■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 GNAT2P19087 354 aa23.22■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 SFMBT2Q5VUG0 894 aa23.22■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.22■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 CCSER1Q9C0I3 900 aa23.22■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 ADAM7Q9H2U9 754 aa23.22■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 SERPING1P05155 500 aa23.21■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 FESP07332 822 aa23.21■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 KRT16P08779 473 aa23.21■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 RPS6KA3P51812 740 aa23.21■■□□□ 1.31
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ODC1-201ENST00000234111 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa23.21■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 ZFATQ9P243 1243 aa23.21■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 MYBL1P10243 752 aa23.21■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 CENPPQ6IPU0 288 aa23.21■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 KCNV2Q8TDN2 545 aa23.21■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 TRIM31Q9BZY9 425 aa23.21■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa23.21■■□□□ 1.31
ODC1-201ENST00000234111 KRIT1O00522 736 aa23.2■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 IFNAR2P48551 515 aa23.2■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 SLC18A3Q16572 532 aa23.2■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 SLC30A9Q6PML9 568 aa23.2■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 ACTRT1Q8TDG2 376 aa23.2■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 SMIM23A6NLE4 172 aa23.2■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 SNAP23O00161 211 aa23.2■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 AHCYL1O43865 530 aa23.2■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 ATP4AP20648 1035 aa23.2■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 MMP13P45452 471 aa23.2■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 MYH1P12882 1939 aa23.2■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.19■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 NLRP3Q96P20 1036 aa23.19■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 RGPD5Q99666 1765 aa23.19■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 FLT1P17948 1338 aa23.19■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 TLDC2A0PJX2 215 aa23.19■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 CES2O00748 559 aa23.19■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 NEFHP12036 1026 aa23.19■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 USP11P51784 963 aa23.19■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 GNPTABQ3T906 1256 aa23.19■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 FAM83BQ5T0W9 1011 aa23.19■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 CNNM4Q6P4Q7 775 aa23.19■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 HOOK3Q86VS8 718 aa23.19■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 BLIDQ8IZY5 108 aa23.19■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 KLHL29Q96CT2 875 aa23.19■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa23.19■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.18■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 TRAF1Q13077 416 aa23.18■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 TAF11Q15544 211 aa23.18■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 CABP7Q86V35 215 aa23.18■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 DNAAF5Q86Y56 855 aa23.18■■□□□ 1.3
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ODC1-201ENST00000234111 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.18■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 NOL4O94818 638 aa23.18■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 PPP1R2P41236 205 aa23.18■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 TRIM68Q6AZZ1 485 aa23.18■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 METTL13Q8N6R0 699 aa23.18■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 C7orf25Q9BPX7 421 aa23.18■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.31e-9■■□□□ 13.4
ODC1-201ENST00000234111 ADAM22Q9P0K1 906 aa23.18■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.18■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 ATF3P18847 181 aa23.17■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 TRIM51Q9BSJ1 452 aa23.17■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 IRAK4Q9NWZ3 460 aa23.17■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 CEP72Q9P209 647 aa23.17■■□□□ 1.3
ODC1-201ENST00000234111 CALM1P0DP23 149 aa23.17■■□□□ 1.3
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