RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J SKS1Q12505 502 aa2.45□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J STE7P06784 515 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J ALG7P07286 448 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J ARD1P07347 238 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J PBS2P08018 668 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J TY2A-LR1P0C2J4 438 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J TY2A-FP0CX61 438 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J TY2A-GR2P0CX62 438 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J ARF1P11076 181 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J MCM1P11746 286 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J DAT1P13483 248 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J OCA4P25366 362 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J TY2A-CP25383 438 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J SPB1P25582 841 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J SYP1P25623 870 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J RPC19P28000 142 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J NFU1P32860 256 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J SSO1P32867 290 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J SPO23P33757 523 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J PTC1P35182 281 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J DHR2P36009 735 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J GLG1P36143 616 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YCR087C-AP37263 153 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J APD1P38281 316 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J APE4P38821 490 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J TAT2P38967 592 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J FRT2P39734 528 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J LSM4P40070 187 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J JEM1P40358 645 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YIL169CP40442 995 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J ECO1P43605 281 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J AIM22P47051 409 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J GTO1P48239 356 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J ATP22P50273 684 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J MUP1P50276 574 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J SEH1P53011 349 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J ARI1P53111 347 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR012WP53206 393 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR067CP53243 804 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J HOL1P53389 586 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J ATG4P53867 494 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J SLM2P53955 656 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL010WP53981 241 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J TY2A-DR2Q03483 438 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR010WQ03687 405 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J GIS1Q03833 894 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J MIX14Q04341 121 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J STE23Q06010 1027 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J ISR1Q06098 443 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J GMC2Q06201 188 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YLL007CQ07799 665 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YLL054CQ12244 843 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J TY2A-BQ12260 438 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J TY2A-OR2Q12293 438 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J TY2A-DR1Q12392 438 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J TY2A-OR1Q12439 438 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J TY2A-DR3Q99303 438 aa2.44□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J RAS2P01120 322 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS17AP02407 136 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS17BP14127 136 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J NCP1P16603 691 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J SRV2P17555 526 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J SLY41P22215 453 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J ERG8P24521 451 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J NPP1P25353 742 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J STP22P25604 385 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J CAT2P32796 670 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J MSN2P33748 704 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS51P36116 164 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J SET3P36124 751 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YBL029WP38201 376 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J FES1P38260 290 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J PZF1P39933 429 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J AST2P39945 430 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YEN1P40028 759 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J GIP2P40036 548 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J TOK1P40310 691 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J LAS21P40367 830 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J LYS12P40495 371 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J CEP3P40969 608 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J LEM3P42838 414 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPS18P42847 217 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J ALB1P47019 175 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J MDV1P47025 714 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J BNA3P47039 444 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J MPS3P47069 682 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J EMC2P47133 292 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J TPC1P53257 314 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J MPA43P53583 542 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J RHO4Q00246 291 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL071CQ02864 156 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL107WQ02873 248 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J INP1Q03694 420 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J TVP15Q03860 143 aa2.43□□□□□ -2.02
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR124WQ04608 324 aa2.43□□□□□ -2.02
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