RNA–Protein interactions for RNA: YPL079W

RPL21B, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L21B, yeast

Gene RPL21B, Length 483 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL21B	YPL079W	MER1	P16523	270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	FAR1	P21268	830 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	GRR1	P24814	1151 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	AGP1	P25376	633 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	ITR2	P30606	609 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	NUP2	P32499	720 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	SEA4	P38164	1038 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	RRN10	P38204	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	KRE29	P40026	464 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	APQ12	P40532	138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	PRM10	P42946	383 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YFR018C	P43599	363 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	BIR1	P47134	954 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	PRM8	P53174	237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	FHN1	P53279	174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	EAR1	Q03212	550 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	TLG1	Q03322	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	MRX10	Q05648	414 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	NDL1	Q06568	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	MCM21	Q06675	368 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	PUN1	Q06991	263 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	PLB3	Q08108	686 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	NTG2	Q08214	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	DCI1	Q08558	271 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	SUL2	Q12325	893 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	MPD2	Q99316	277 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	MET17	P06106	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	CDC4	P07834	779 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	RER1	P25560	188 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	MKK1	P32490	508 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	SSO1	P32867	290 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YBR139W	P38109	508 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	WSC4	P38739	605 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	GIC1	P38785	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	AIM2	P39721	246 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	FAU1	P40099	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	TED1	P40533	473 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	HMS2	P47175	358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YGR079W	P53249	370 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	SWP1	Q02795	286 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	FMP42	Q04991	504 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	TEN1	Q07921	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	OPI10	Q08202	246 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	BMT6	Q12291	365 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YPR064W	Q12492	139 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	RIB3	Q99258	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	PUT2	P07275	575 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	ENA1	P13587	1091 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	KSS1	P14681	368 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YCL049C	P25577	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
RPL21B	YPL079W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	PET127	P32606	800 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	SPT23	P35210	1082 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	TUL1	P36096	758 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	APT2	P36973	181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	MNN2	P38069	597 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	BNA4	P38169	460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	MTG2	P38860	518 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YHR177W	P38867	453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	AXL2	P38928	823 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	MBP1	P39678	833 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	SPO73	P40031	143 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	SOK1	P40317	901 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	FAR7	P43592	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	SLD3	P53135	668 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	CDH1	P53197	566 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	CWC24	P53769	259 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	BNI4	P53858	892 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	TGL2	P54857	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YPL113C	Q02961	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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