RNA–Protein interactions for RNA: YLR117C

CLF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene CLF1, Length 2,064 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLF1	YLR117C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	RGS2	Q99188	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PHO5	P00635	467 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	FLP1	P03870	423 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	BI4	P03879	638 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	SPS4	P09937	338 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	IFM1	P25038	676 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	DAL80	P26343	269 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	FUN30	P31380	1131 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	MCM10	P32354	571 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YKR051W	P36142	418 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	MMS4	P38257	691 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	MBA1	P38300	278 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	ATG12	P38316	186 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	SUL1	P38359	859 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PPE1	P38796	400 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	SCC4	P40090	624 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	MGS1	P40151	587 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YIL166C	P40445	542 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	IMA5	P40884	581 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	NSE4	P43124	402 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	GYP8	P43570	497 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	RET2	P43621	546 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TAH11	P47112	604 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	MOG1	P47123	218 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	COS12	P53053	380 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	SWC4	P53201	476 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	GIM3	P53900	129 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YPL113C	Q02961	396 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	CSN9	Q03981	162 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	SYT1	Q06836	1226 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	CYK3	Q07533	885 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	DSE3	Q08729	430 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	ECM3	Q99252	613 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	FRT1	Q99332	602 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	CIT2	P08679	460 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PHO80	P20052	293 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	SIR1	P21691	654 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	HCM1	P25364	564 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	GLC3	P32775	704 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	ECT1	P33412	323 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	SEF1	P34228	1148 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	MAL32	P38158	584 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	AVT5	P38176	459 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TOS1	P38288	455 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	IKI1	P38874	309 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	AIM18	P38884	321 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	FAD1	P38913	306 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	ERV46	P39727	415 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	RGI2	P40188	164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	ARG2	P40360	574 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	HIS6	P40545	261 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	IRC24	P40580	263 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	ASG7	P46993	209 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	SNN1	P48232	102 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	DIA3	P52290	468 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	SCW11	P53189	542 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	MAL12	P53341	584 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	MRPL22	P53881	309 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	NIS1	P53939	407 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	VPS9	P54787	451 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	REG1	Q00816	1014 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TRS130	Q03660	1102 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TPP1	Q03796	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	VID22	Q05934	901 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	GAS2	Q06135	555 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	GPI11	Q06636	219 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YPR084W	Q06821	456 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	ATG20	Q07528	640 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	GUP2	Q08929	609 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	LCB4	Q12246	624 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YLR108C	Q12259	485 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	CDC50	P25656	391 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	MRPL6	P32904	214 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TOK1	P40310	691 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TMA108	P40462	946 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YIL024C	P40543	189 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	AAD10	P47182	288 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	CLA4	P48562	842 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67

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