RNA–Protein interactions for RNA: YLL049W

LDB18, Transcript of Component of the dynactin complex, yeast

Gene LDB18, Length 540 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LDB18	YLL049W	YBR071W	P38243	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	TDP1	P38319	544 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	TCD1	P38756	429 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	PKP1	P40530	394 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	PRM2	P40534	656 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	MAD2	P40958	196 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	TEL2	P53038	688 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	BOL2	P53082	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	GPG1	P53130	126 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	YGR045C	P53229	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	CLD1	P53264	445 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	BOP3	P53958	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	YPR011C	Q12251	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	VPS33	P20795	691 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	APN1	P22936	367 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	NFS1	P25374	497 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	URA10	P30402	227 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	RRN3	P36070	627 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	MUP3	P38734	546 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	EMP65	P40085	556 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	IRC6	P43615	237 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	STE24	P47154	453 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	YJR120W	P47157	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	MKC7	P53379	596 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	REC102	Q02721	264 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	GOT1	Q03554	138 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	CDC123	Q05791	360 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	SAC7	P17121	654 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	TRX3	P25372	127 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	SPS22	P25380	463 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	ATS1	P31386	333 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	YMR262W	P38430	313 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	MSG5	P38590	489 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	BZZ1	P38822	633 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	GAT2	P40209	560 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	YIL169C	P40442	995 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	TED1	P40533	473 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	RPE1	P46969	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	RAD17	P48581	401 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	MAL12	P53341	584 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	FAR10	Q06001	478 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	SRN2	Q99176	213 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	ERS1	P17261	260 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	DAP2	P18962	818 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	SPC29	P33419	253 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	YKL100C	P34248	587 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	BAP2	P38084	609 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	IFA38	P38286	347 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
LDB18	YLL049W	PRM10	P42946	383 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	MNN5	P46982	586 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	YNL260C	P53846	198 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	TAF12	Q03761	539 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	HFD1	Q04458	532 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	APC4	Q04601	652 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	RAD34	Q06665	692 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	ATG23	Q06671	453 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	REX4	Q08237	289 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	MLH3	Q12083	715 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	RAD1	P06777	1100 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	STE12	P13574	688 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	MGT1	P26188	188 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	PTM1	P32857	523 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	AFR1	P33304	620 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	YJL206C	P39529	758 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	EFM4	P40516	257 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
LDB18	YLL049W	RIM8	P53179	542 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	YGR079W	P53249	370 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LDB18	YLL049W	COG6	P53959	839 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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