RNA–Protein interactions for RNA: YLL003W

SFI1, Transcript of Centrin (Cdc31p)-binding protein required for SPB duplication, yeast

Gene SFI1, Length 2,841 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SFI1	YLL003W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SFM1	Q12314	213 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SWI5	P08153	709 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	RAD18	P10862	487 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	CKA1	P15790	372 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	MRPL44	P19956	98 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PER1	P25625	357 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	RNP1	P32385	249 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	POP4	P38336	279 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	TAE1	P38340	232 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	HIS6	P40545	261 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SLS1	P42900	643 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PKP2	P53170	491 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	URH1	Q04179	340 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	MSC3	Q05812	728 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	OPT2	Q06593	877 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	COS7	Q07788	383 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	CRT10	Q08226	957 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	ELG1	Q12050	791 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	HRT3	Q12347	344 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	RMP1	Q12530	201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	COQ1	P18900	473 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	MBR1	P23493	339 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	RAD14	P28519	371 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PEX3	P28795	441 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	LIP5	P32875	414 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PFF1	P38244	976 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	DSE1	P40077	573 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YAR1	P46683	200 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PHO86	P46956	311 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YGL108C	P53139	140 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	TIM10	P87108	93 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	NEJ1	Q06148	342 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SLD7	Q08457	257 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	FLC1	Q08967	793 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SUL2	Q12325	893 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PSF1	Q12488	208 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	HAP2	P06774	265 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	RRT12	P25381	491 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YCR051W	P25631	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	GSY2	P27472	705 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PDR3	P33200	976 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SPC29	P33419	253 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	CSG2	P35206	410 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	BET3	P36149	193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	GDH3	P39708	457 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	VRG4	P40107	337 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	FET5	P43561	622 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	IRC7	P43623	340 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YNL115C	P53925	644 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	OCA2	P53949	197 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	DLT1	Q04216	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	GIS4	Q04233	774 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	AIM32	Q04689	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	BLS1	Q06071	122 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YNG1	Q08465	219 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SIR1	P21691	654 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SCM4	P32564	187 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YKL071W	P36086	256 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	EXO1	P39875	702 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	MGS1	P40151	587 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	CIN1	P40987	1014 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YGR210C	P42942	411 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YGR053C	P53234	283 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	YDR278C	Q05612	105 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	ECM30	Q06673	1274 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	HRD1	Q08109	551 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	PEX15	Q08215	383 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SFI1	YLL003W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68

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