RNA–Protein interactions for RNA: YHR065C

RRP3, Transcript of Protein involved in rRNA processing, yeast

Gene RRP3, Length 1,506 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP3	YHR065C	YNL033W	P53964	284 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	YNL019C	P53975	284 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	SMA1	Q02651	245 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	GIP3	Q03016	1276 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	PLB2	Q03674	706 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	ROT1	Q03691	256 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	NMD4	Q12129	218 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	SUL2	Q12325	893 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	CMP2	P14747	604 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	UGA1	P17649	471 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	URA4	P20051	364 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	CLB3	P24870	427 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	AST1	P35183	429 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	MRP8	P35719	219 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	YBR241C	P38142	488 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	GGC1	P38988	300 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	BEM4	P39011	633 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	COS12	P53053	380 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	YGR016W	P53209	190 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	GPI1	P53306	609 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	GOR1	P53839	350 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	DSL1	P53847	754 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	YNL140C	P53910	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	UGO1	Q03327	502 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	RAD33	Q04231	177 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
RRP3	YHR065C	SRO7	Q12038	1033 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	ULA1	Q12059	462 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	STT4	P37297	1900 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	ARG3	P05150	338 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	PRI2	P20457	528 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	CTS1	P29029	562 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	NGG1	P32494	702 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	ATO2	P32907	282 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	EMC3	P36039	253 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	GLG1	P36143	616 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	TDP1	P38319	544 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	FAD1	P38913	306 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	FAA2	P39518	744 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	ECM10	P39987	644 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	CAB2	P40506	365 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	YFR020W	P43600	232 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	YJR142W	P47173	342 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	AAT1	Q01802	451 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	MET31	Q03081	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	SIZ1	Q04195	904 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	YKU80	Q04437	629 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	VPS74	Q06385	345 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	YLL007C	Q07799	665 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	GET4	Q12125	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	RPN6	Q12377	434 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	MSB2	P32334	1306 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	ARG81	P05085	880 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	ATP4	P05626	244 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	TRX3	P25372	127 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	RML2	P32611	393 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	SPO23	P33757	523 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	PEX6	P33760	1030 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	KKQ8	P36004	724 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	SKG1	P36169	355 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	COS111	P38308	924 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	ATG7	P38862	630 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	YHR218W	P38899	603 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	FMP32	P43557	207 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRP3	YHR065C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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