RNA–Protein interactions for RNA: YHR004C

NEM1, Transcript of Probable catalytic subunit of Nem1p-Spo7p phosphatase holoenzyme, yeast

Gene NEM1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEM1	YHR004C	YRM1	Q12340	786 aa		3.67	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	PUT4	P15380	627 aa		3.66	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	YIM1	P28625	365 aa		3.66	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	YME2	P32843	850 aa		3.66	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	MRP4	P32902	394 aa		3.66	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	SEC66	P33754	206 aa		3.66	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	ELO1	P39540	310 aa		3.66	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	ALG5	P40350	334 aa		3.66	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	LCL3	P53153	274 aa		3.66	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	RSM23	Q01163	450 aa		3.66	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
NEM1	YHR004C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	ADH7	P25377	361 aa		3.65	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	YCR022C	P25620	114 aa		3.65	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	COY1	P34237	679 aa		3.65	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	PCH2	P38126	564 aa		3.65	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	YSW1	P38280	609 aa		3.65	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	PET130	P47065	347 aa		3.65	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	FMS1	P50264	508 aa		3.65	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	YGL138C	P53122	345 aa		3.65	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	YGR127W	P53275	312 aa		3.65	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	YLR413W	Q06689	675 aa		3.65	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	YFH1	Q07540	174 aa		3.65	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	SPE4	Q12455	300 aa		3.65	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	HIP1	P06775	603 aa		3.64	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	NDI1	P32340	513 aa		3.64	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	YGR149W	P48236	432 aa		3.64	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	PRM1	P53835	661 aa		3.64	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	DUG3	P53871	357 aa		3.64	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	ARK1	P53974	638 aa		3.64	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	SKO1	Q02100	647 aa		3.64	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	SHR3	Q02774	210 aa		3.64	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	TAP42	Q04372	366 aa		3.64	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	VPS74	Q06385	345 aa		3.64	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	UAF30	Q08747	228 aa		3.64	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	YML133C	Q03099	1374 aa		3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	YLL067C	Q07888	1374 aa		3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	YLL066C	Q99208	1374 aa		3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	PDE2	P06776	526 aa		3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	PEP5	P12868	1029 aa		3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	MER1	P16523	270 aa		3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	SPO7	P18410	259 aa		3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	RAD51	P25454	400 aa		3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	AFG1	P32317	509 aa		3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	RML2	P32611	393 aa		3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	SLM4	P38247	162 aa		3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	CTM1	P38818	585 aa		3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	CCT6	P39079	546 aa		3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.63	□□□□□ -1.83	not detected
NEM1	YHR004C	FAR3	P46671	204 aa		3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	YGR266W	P53326	701 aa		3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	PBA1	Q05778	276 aa		3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	BNA5	Q05979	453 aa		3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	ARV1	Q06541	321 aa		3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	ISN1	Q99312	450 aa		3.63	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	PET123	P17558	318 aa		3.62	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	YBR144C	P34215	104 aa		3.62	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	PIM1	P36775	1133 aa		3.62	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	YBL028C	P38202	106 aa		3.62	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	COS5	P47187	383 aa		3.62	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	CGR1	P53188	120 aa		3.62	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	LSB1	P53281	241 aa		3.62	□□□□□ -1.83

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