RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 SP4Q02446 784 aa25.55■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 SHHQ15465 462 aa25.55■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 IL17RAQ96F46 866 aa25.55■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 VPS54Q9P1Q0 977 aa25.55■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 CSF2RAP15509 400 aa25.54■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 SREBF1P36956 1147 aa25.54■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 AK2P54819 239 aa25.54■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 PTGISQ16647 500 aa25.54■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 C9orf50Q5SZB4 431 aa25.54■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 SESTD1Q86VW0 696 aa25.54■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 MXRA8Q9BRK3 442 aa25.54■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 PKD2L1Q9P0L9 805 aa25.54■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.54■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 NLRP5P59047 1200 aa25.53■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 SCRN1Q12765 414 aa25.53■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 CEP55Q53EZ4 464 aa25.53■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 SH3GLB2Q9NR46 395 aa25.53■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 ATP9AO75110 1047 aa25.52■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 LGALS2P05162 132 aa25.52■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 KCNA2P16389 499 aa25.52■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 NEK4P51957 841 aa25.52■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 CCL23P55773 120 aa25.52■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 ARHGAP4P98171 946 aa25.52■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 LRCH3Q96II8 777 aa25.52■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 GPR20Q99678 358 aa25.52■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 C16orf70Q9BSU1 422 aa25.52■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 KCNH7Q9NS40 1196 aa25.52■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 HDAC6Q9UBN7 1215 aa25.52■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa25.52■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 H3BRB1 525 aa25.52■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 HAS3O00219 553 aa25.52■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 PFKFB2O60825 505 aa25.52■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 SLC34A2O95436 690 aa25.52■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 EPHB4P54760 987 aa25.52■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
SYT6-210ENST00000641643 UMODL1Q5DID0 1318 aa25.51■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 RETREG2Q8NC44 543 aa25.51■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 CYP2W1Q8TAV3 490 aa25.51■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 BFSP2Q13515 415 aa25.5■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 CCDC155Q8N6L0 562 aa25.5■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 RASGRP4Q8TDF6 673 aa25.49■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 SDF4Q9BRK5 362 aa25.49■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 IL23AQ9NPF7 189 aa25.49■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 ACRP10323 421 aa25.48■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 SEPT1Q8WYJ6 367 aa25.48■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 WNT8AQ9H1J5 351 aa25.48■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 MEIS1O00470 390 aa25.48■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 PITPNM1O00562 1244 aa25.48■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 CYP3A4P08684 503 aa25.48■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 ARP10275 920 aa25.48■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 XBP1P17861 261 aa25.48■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 CAGE1Q8TC20 777 aa25.48■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 SCLYQ96I15 445 aa25.48■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP25.48■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 TMEM240Q5SV17 173 aa25.47■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 GPR153Q6NV75 609 aa25.47■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 PLA2G4DQ86XP0 818 aa25.47■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 PCDHA4Q9UN74 947 aa25.47■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 C17orf102A2RUQ5 167 aa25.46■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 ADAMTS3O15072 1205 aa25.46■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 ZNF365Q70YC5 407 aa25.46■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 C16orf59Q7L2K0 433 aa25.46■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 NIPA1Q7RTP0 329 aa25.46■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 TRIM50Q86XT4 487 aa25.46■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.46■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 DOCK5Q9H7D0 1870 aa25.46■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 SLC9A2Q9UBY0 812 aa25.46■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 TELO2Q9Y4R8 837 aa25.46■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 NFASCO94856 1347 aa25.46■■□□□ 1.67
SYT6-210ENST00000641643 FAM86B1E9PN63 330 aa25.45■■□□□ 1.66
SYT6-210ENST00000641643 FAM86B2P0C5J1 330 aa25.45■■□□□ 1.66
SYT6-210ENST00000641643 ME3Q16798 604 aa25.45■■□□□ 1.66
SYT6-210ENST00000641643 GALNT17Q6IS24 598 aa25.45■■□□□ 1.66
SYT6-210ENST00000641643 CRYGNQ8WXF5 182 aa25.45■■□□□ 1.66
SYT6-210ENST00000641643 GLG1Q92896 1179 aa25.45■■□□□ 1.66
SYT6-210ENST00000641643 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
SYT6-210ENST00000641643 STK36Q9NRP7 1315 aa25.45■■□□□ 1.66
SYT6-210ENST00000641643 FGBP02675 491 aa25.44■■□□□ 1.66
SYT6-210ENST00000641643 IQCF3P0C7M6 154 aa25.44■■□□□ 1.66
SYT6-210ENST00000641643 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa25.44■■□□□ 1.66
SYT6-210ENST00000641643 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa25.44■■□□□ 1.66
SYT6-210ENST00000641643 GNAT1P11488 350 aa25.44■■□□□ 1.66
SYT6-210ENST00000641643 SETQ01105 290 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
SYT6-210ENST00000641643 NECAB1Q8N987 351 aa25.44■■□□□ 1.66
SYT6-210ENST00000641643 AFAP1L1Q8TED9 768 aa25.44■■□□□ 1.66
SYT6-210ENST00000641643 AIFM3Q96NN9 605 aa25.44■■□□□ 1.66
SYT6-210ENST00000641643 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa25.44■■□□□ 1.66
SYT6-210ENST00000641643 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
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