RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635899.1

CREBBP-215, Transcript of CREB binding protein, human

TSL 5

Gene CREBBP, Length 100 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CREBBP-215	ENST00000635899	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	TREH	O43280	583 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	UPP2	O95045	317 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	IGHD	P01880	384 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	RSPH10B	P0C881	870 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	POLR2M	P0CAP2	368 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	IL9	P15248	144 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	KCNA5	P22460	613 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	ERVK-21	P61565	698 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	WTAP	Q15007	396 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	SERINC5	Q86VE9	423 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	ANKS1A	Q92625	1134 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	MTMR8	Q96EF0	704 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	YME1L1	Q96TA2	773 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	RAD9A	Q99638	391 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	INSL6	Q9Y581	213 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	TCHH	Q07283	1943 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899		H3BRB1	525 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	FIBP	O43427	364 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	CYTH3	O43739	400 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	CYP21A2	P08686	494 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	MARK3	P27448	753 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	HOXC8	P31273	242 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	CTNNB1	P35222	781 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	ARHGAP4	P98171	946 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	SP2	Q02086	613 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	TRAF1	Q13077	416 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	SEMA3F	Q13275	785 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	AAMP	Q13685	434 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	PTPRO	Q16827	1216 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	TTC22	Q5TAA0	569 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	NCOA7	Q8NI08	942 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	SEPT8	Q92599	483 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	MYL10	Q9BUA6	226 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	SENP2	Q9HC62	589 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	VWA8	A3KMH1	1905 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899		E7EWF7	191 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	CAND2	O75155	1236 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	PPFIA4	O75335	1185 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	STAM2	O75886	525 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	DDAH1	O94760	285 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	TGFB3	P10600	412 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CREBBP-215	ENST00000635899	GHR	P10912	638 aa		5.17	□□□□□ -1.58

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms