RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635397.1

SMARCA2-241, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, humanhuman

TSL 4

Gene SMARCA2, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2-241ENST00000635397 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 C19orf44Q9H6X5 657 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 GPR160Q9UJ42 338 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 DSEQ9UL01 958 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 MAFKO60675 156 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 ULK1O75385 1050 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 ALDH1L1O75891 902 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 WNT11O96014 354 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 RAC2P15153 192 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF174Q15697 407 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 CHRNA2Q15822 529 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 STEAP3Q658P3 488 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 CREB3L3Q68CJ9 461 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 PASD1Q8IV76 773 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 LILRA2Q8N149 483 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 EFHBQ8N7U6 833 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 AGBL5Q8NDL9 886 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 SH3RF2Q8TEC5 729 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 TRIM8Q9BZR9 551 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 SP110Q9HB58 689 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 SRPK3Q9UPE1 567 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 NUB1Q9Y5A7 615 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 MAN2B1O00754 1011 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 SCDO00767 359 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 HIP1RO75146 1068 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 PRKD3O94806 890 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 EFEMP2O95967 443 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 ARL4AP40617 200 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 NLRX1Q86UT6 975 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 SIRT2Q8IXJ6 389 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 NLGN4XQ8N0W4 816 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 MYLIPQ8WY64 445 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 SCYL1Q96KG9 808 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 CD244Q9BZW8 370 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 PCMTD2Q9NV79 361 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 TRHDEQ9UKU6 1024 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 HGSO14964 777 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC27A2O14975 620 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC9A1P19634 815 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 GALK1P51570 392 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 SNX17Q15036 470 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 TIGD5Q53EQ6 642 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 FIGNQ5HY92 759 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 EMC4Q5J8M3 183 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 NOSTRINQ8IVI9 506 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 KIAA1958Q8N8K9 716 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 NETO2Q8NC67 525 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC5A5Q92911 643 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 PCIF1Q9H4Z3 704 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 CHPF2Q9P2E5 772 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 ATP23Q9Y6H3 246 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 TGM5O43548 720 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 TADA3O75528 432 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 GLI4P10075 376 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 PNLIPP16233 465 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC6A11P48066 632 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 KIF11P52732 1056 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 FAPQ12884 760 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 DDB1Q16531 1140 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 CPZQ66K79 652 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 FSTL4Q6MZW2 842 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 CYP4F22Q6NT55 531 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 SEC14L1Q92503 715 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 AP5M1Q9H0R1 490 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 TOMM22Q9NS69 142 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 CTNND2Q9UQB3 1225 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 SIT1Q9Y3P8 196 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 SPO11Q9Y5K1 396 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 DVL2O14641 736 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 EPHB1P54762 984 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 SESN3P58005 492 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF792Q3KQV3 632 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 SYDE2Q5VT97 1194 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 KCTD1Q719H9 257 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 SHISA4Q96DD7 197 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 RXFP1Q9HBX9 757 aa7.28□□□□□ -1.24
SMARCA2-241ENST00000635397 VTA1Q9NP79 307 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms