RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM60Q9H2L4 133 aa9.64□□□□□ -0.87
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SGMS1-211ENST00000626236 KCNH7Q9NS40 1196 aa9.64□□□□□ -0.87
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SGMS1-211ENST00000626236 CEP131Q9UPN4 1083 aa9.64□□□□□ -0.87
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SGMS1-211ENST00000626236 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa9.61□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC62Q6P9F0 684 aa9.61□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 DTHD1Q6ZMT9 781 aa9.61□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 CYFIP1Q7L576 1253 aa9.61□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 KCNG4Q8TDN1 519 aa9.61□□□□□ -0.87
SGMS1-211ENST00000626236 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
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