RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
SRRT-218ENST00000620394 CCND2P30279 289 aa25.46■■□□□ 1.67
SRRT-218ENST00000620394 MCM5P33992 734 aa25.46■■□□□ 1.67
SRRT-218ENST00000620394 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
SRRT-218ENST00000620394 IKBKEQ14164 716 aa25.46■■□□□ 1.67
SRRT-218ENST00000620394 LEXMQ3ZCV2 418 aa25.46■■□□□ 1.67
SRRT-218ENST00000620394 MYSM1Q5VVJ2 828 aa25.46■■□□□ 1.67
SRRT-218ENST00000620394 MYL10Q9BUA6 226 aa25.46■■□□□ 1.67
SRRT-218ENST00000620394 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 LIFRP42702 1097 aa25.45■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 PTK7Q13308 1070 aa25.45■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 CREB3L3Q68CJ9 461 aa25.45■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 TMTC2Q8N394 836 aa25.45■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 LZTS2Q9BRK4 669 aa25.45■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 CD320Q9NPF0 282 aa25.45■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 HDAC6Q9UBN7 1215 aa25.45■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 PSEN2P49810 448 aa25.44■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 FCHSD1Q86WN1 690 aa25.44■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 DOCK5Q9H7D0 1870 aa25.44■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 EMSYQ7Z589 1322 aa25.43■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 PRR33A8MZF0 331 aa25.43■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 STAM2O75886 525 aa25.43■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 GGPS1O95749 300 aa25.43■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 ZNF286BP0CG31 522 aa25.43■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 KCNA5P22460 613 aa25.43■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 GNAQP50148 359 aa25.43■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 SP2Q02086 613 aa25.43■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 MFSD10Q14728 455 aa25.43■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 TCTN1Q2MV58 587 aa25.43■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 FAM178BQ8IXR5 827 aa25.43■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 GJD3Q8N144 294 aa25.43■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 COL4A6Q14031 1691 aa25.42■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 PIK3CDO00329 1044 aa25.42■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 PPFIA4O75335 1185 aa25.42■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 KIAA0753Q2KHM9 967 aa25.42■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 HSDL1Q3SXM5 330 aa25.42■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 FBXO22Q8NEZ5 403 aa25.42■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 ALG1Q9BT22 464 aa25.42■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 ANO2Q9NQ90 1003 aa25.42■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 INSL6Q9Y581 213 aa25.42■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 NLRC5Q86WI3 1866 aa25.41■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 LGR5O75473 907 aa25.41■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 PLEKHA8P1O95397 391 aa25.41■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 CALM1P0DP23 149 aa25.41■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 CALM2P0DP24 149 aa25.41■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 CALM3P0DP25 149 aa25.41■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 ICAM3P32942 547 aa25.41■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 ZNF618Q5T7W0 954 aa25.41■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 TRAF7Q6Q0C0 670 aa25.41■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 SGMS1Q86VZ5 419 aa25.41■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP25.41■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 SPATA33Q96N06 139 aa25.41■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 MUC6Q6W4X9 2439 aa25.41■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 CCDC69A6NI79 296 aa25.4■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 AMHP03971 560 aa25.4■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 MBTPS1Q14703 1052 aa25.4■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 GNPTABQ3T906 1256 aa25.4■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 FAM117BQ6P1L5 589 aa25.4■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 NFXL1Q6ZNB6 911 aa25.4■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 PIBF1Q8WXW3 757 aa25.4■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa25.39■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 MEIS2O14770 477 aa25.39■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 PTPROQ16827 1216 aa25.39■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 TIGD5Q53EQ6 642 aa25.39■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 SKAP1Q86WV1 359 aa25.39■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 C17orf80Q9BSJ5 609 aa25.39■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 C16orf70Q9BSU1 422 aa25.39■■□□□ 1.66
SRRT-218ENST00000620394 ALADP13716 330 aa25.38■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 IL9P15248 144 aa25.38■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 SEMA3FQ13275 785 aa25.38■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 XRRA1Q6P2D8 792 aa25.38■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 WNT8BQ93098 351 aa25.38■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 SAMD11Q96NU1 681 aa25.38■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa25.37■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 FIBPO43427 364 aa25.37■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 RXRAP19793 462 aa25.37■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 HOXC8P31273 242 aa25.37■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 RNF20Q5VTR2 975 aa25.37■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 PCNX4Q63HM2 1172 aa25.37■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 USP17L6PQ6QN14 398 aa25.37■■□□□ 1.65
SRRT-218ENST00000620394 TMTC3Q6ZXV5 915 aa25.37■■□□□ 1.65
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