RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		16.08	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	PIK3CD	O00329	1044 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	RSPH10B	P0C881	870 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	COL9A1	P20849	921 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	THPO	P40225	353 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	NEDD9	Q14511	834 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	MAP4K1	Q92918	833 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	HLA-C	Q95604	372 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	16.07	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	USP26	Q9BXU7	913 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	PTPRS	Q13332	1948 aa		16.07	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	FIBP	O43427	364 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	DDAH1	O94760	285 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	16.06	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	SMARCA1	P28370	1054 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	16.06	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	16.06	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	16.06	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	GPR20	Q99678	358 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	MTA3	Q9BTC8	594 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	INSL6	Q9Y581	213 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	16.05	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	16.05	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	TREH	O43280	583 aa		16.05	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	AMH	P03971	560 aa		16.05	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	ADAM17	P78536	824 aa		16.05	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		16.05	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		16.05	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		16.05	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	LY9	Q9HBG7	655 aa		16.05	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	COL4A6	Q14031	1691 aa		16.05	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	MYH6	P13533	1939 aa		16.04	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	MEIS2	O14770	477 aa		16.04	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	KIF5B	P33176	963 aa		16.04	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		16.04	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	TRIM50	Q86XT4	487 aa		16.04	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		16.04	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	16.04	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		16.04	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	16.04	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	16.04	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	GNAT1	P11488	350 aa		16.03	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		16.03	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		16.03	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		16.03	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	16.03	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	SEPT8	Q92599	483 aa		16.03	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		16.03	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		16.03	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		16.03	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	SETD4	Q9NVD3	440 aa		16.03	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		16.03	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	16.03	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		16.03	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	FAM26D	Q5JW98	314 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	RPAIN	Q86UA6	219 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	TOP1MT	Q969P6	601 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	MYL10	Q9BUA6	226 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MUC1-222	ENST00000610468	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	PRC1	O43663	620 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	CTSH	P09668	335 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	GNAQ	P50148	359 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	NLRX1	Q86UT6	975 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	APBB2	Q92870	758 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	CUL5	Q93034	780 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	GPRASP2	Q96D09	838 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	SAMD11	Q96NU1	681 aa		16.01	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	NRCAM	Q92823	1304 aa		16	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		16	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	KCNA2	P16389	499 aa		16	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	ITGB5	P18084	799 aa		16	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	MCM5	P33992	734 aa		16	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	LIFR	P42702	1097 aa		16	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	16	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	CASC1	Q6TDU7	716 aa		16	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	TMTC2	Q8N394	836 aa		16	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
MUC1-222	ENST00000610468	CDHR1	Q96JP9	859 aa		16	■□□□□ 0.15

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 139.9 ms