RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597071.5

LTBP4-216, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene LTBP4, Length 670 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4-216ENST00000597071 CDC27P30260 824 aa14.97□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 HOXC8P31273 242 aa14.97□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 PTK7Q13308 1070 aa14.97□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 Q6ZUG5 572 aa14.97□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 LRRC8DQ7L1W4 858 aa14.97□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.97□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 MYLIPQ8WY64 445 aa14.97□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 CDHR1Q96JP9 859 aa14.97□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 GPR20Q99678 358 aa14.97□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.97□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 ZNF576Q9H609 170 aa14.97□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.97□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.97□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa14.97□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa14.97□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 ZBBXA8MT70 800 aa14.96□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 H3BRB1 525 aa14.96□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 STXBP3O00186 592 aa14.96□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 CKBP12277 381 aa14.96□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 ACTN1P12814 892 aa14.96□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 SELPP16109 830 aa14.96□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 KCNA2P16389 499 aa14.96□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 ITGB5P18084 799 aa14.96□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 RPS6KB1P23443 525 aa14.96□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.012e-7■■□□□ 12.5
LTBP4-216ENST00000597071 NAPAP54920 295 aa14.96□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 FGD1P98174 961 aa14.96□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 APOBRQ0VD83 1088 aa14.96□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 HIC1Q14526 733 aa14.96□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 BRF1Q92994 677 aa14.96□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 WNT8BQ93098 351 aa14.96□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 USP26Q9BXU7 913 aa14.96□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.96□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 RIC8AQ9NPQ8 531 aa14.96□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 BARHL2Q9NY43 387 aa14.96□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
LTBP4-216ENST00000597071 PTPRSQ13332 1948 aa14.96□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 TRANK1O15050 2925 aa14.95□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa14.95□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 PARNO95453 639 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 FOSL2P15408 326 aa14.95□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 ADCY7P51828 1080 aa14.95□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 GPNMBQ14956 572 aa14.95□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 GRIN2CQ14957 1233 aa14.95□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 TRAF7Q6Q0C0 670 aa14.95□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 JADE2Q9NQC1 790 aa14.95□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 MSRAQ9UJ68 235 aa14.95□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 TELO2Q9Y4R8 837 aa14.95□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.94□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 ATP9AO75110 1047 aa14.94□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 BAIAP3O94812 1187 aa14.94□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 CXCL10P02778 98 aa14.94□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa14.94□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa14.94□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 PSMA5P28066 241 aa14.94□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 AP3B2Q13367 1082 aa14.94□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 MTMR1Q13613 665 aa14.94□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 SERINC5Q86VE9 423 aa14.94□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 TRIM50Q86XT4 487 aa14.94□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 SLC9A7Q96T83 725 aa14.94□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 ANO3Q9BYT9 981 aa14.94□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.94□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa14.94□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 KAT6AQ92794 2004 aa14.93□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 VCANP13611 3396 aa14.93□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 MAFGO15525 162 aa14.93□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 NBNO60934 754 aa14.93□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 SCG2P13521 617 aa14.93□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 CLK2P49760 499 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 RABGGTBP53611 331 aa14.93□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 EVCP57679 992 aa14.93□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 SP4Q02446 784 aa14.93□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 ERICH6BQ5W0A0 696 aa14.93□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa14.93□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa14.93□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 ESYT2A0FGR8 921 aa14.92□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 SMCO2A6NFE2 343 aa14.92□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 SREBF1P36956 1147 aa14.92□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 MBTPS1Q14703 1052 aa14.92□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.92□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 CNKSR3Q6P9H4 555 aa14.92□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.92□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 PGBD1Q96JS3 809 aa14.92□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.92□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 RNPEPQ9H4A4 650 aa14.92□□□□□ -0.02
LTBP4-216ENST00000597071 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms